Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q9

Rapgef5, Rap guanine nucleotide exchange factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 814 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef5Q8C0Q9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rapgef5Q8C0Q9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rapgef5Q8C0Q9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rapgef5Q8C0Q9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rapgef5Q8C0Q9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rapgef5Q8C0Q9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rapgef5Q8C0Q9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rapgef5Q8C0Q9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rapgef5Q8C0Q9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rapgef5Q8C0Q9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rapgef5Q8C0Q9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rapgef5Q8C0Q9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rapgef5Q8C0Q9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rapgef5Q8C0Q9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rapgef5Q8C0Q9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rapgef5Q8C0Q9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rapgef5Q8C0Q9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rapgef5Q8C0Q9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rapgef5Q8C0Q9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rapgef5Q8C0Q9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rapgef5Q8C0Q9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rapgef5Q8C0Q9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rapgef5Q8C0Q9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rapgef5Q8C0Q9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rapgef5Q8C0Q9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rapgef5Q8C0Q9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rapgef5Q8C0Q9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rapgef5Q8C0Q9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rapgef5Q8C0Q9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rapgef5Q8C0Q9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rapgef5Q8C0Q9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rapgef5Q8C0Q9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rapgef5Q8C0Q9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rapgef5Q8C0Q9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rapgef5Q8C0Q9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rapgef5Q8C0Q9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rapgef5Q8C0Q9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rapgef5Q8C0Q9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rapgef5Q8C0Q9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rapgef5Q8C0Q9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rapgef5Q8C0Q9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rapgef5Q8C0Q9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rapgef5Q8C0Q9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rapgef5Q8C0Q9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rapgef5Q8C0Q9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rapgef5Q8C0Q9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rapgef5Q8C0Q9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rapgef5Q8C0Q9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rapgef5Q8C0Q9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rapgef5Q8C0Q9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rapgef5Q8C0Q9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rapgef5Q8C0Q9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rapgef5Q8C0Q9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rapgef5Q8C0Q9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rapgef5Q8C0Q9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rapgef5Q8C0Q9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rapgef5Q8C0Q9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rapgef5Q8C0Q9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rapgef5Q8C0Q9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rapgef5Q8C0Q9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rapgef5Q8C0Q9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rapgef5Q8C0Q9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rapgef5Q8C0Q9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rapgef5Q8C0Q9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rapgef5Q8C0Q9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rapgef5Q8C0Q9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rapgef5Q8C0Q9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rapgef5Q8C0Q9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rapgef5Q8C0Q9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rapgef5Q8C0Q9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rapgef5Q8C0Q9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rapgef5Q8C0Q9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rapgef5Q8C0Q9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rapgef5Q8C0Q9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rapgef5Q8C0Q9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rapgef5Q8C0Q9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rapgef5Q8C0Q9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rapgef5Q8C0Q9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rapgef5Q8C0Q9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rapgef5Q8C0Q9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rapgef5Q8C0Q9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rapgef5Q8C0Q9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rapgef5Q8C0Q9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rapgef5Q8C0Q9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rapgef5Q8C0Q9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rapgef5Q8C0Q9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rapgef5Q8C0Q9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rapgef5Q8C0Q9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rapgef5Q8C0Q9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rapgef5Q8C0Q9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rapgef5Q8C0Q9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rapgef5Q8C0Q9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rapgef5Q8C0Q9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rapgef5Q8C0Q9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rapgef5Q8C0Q9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rapgef5Q8C0Q9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rapgef5Q8C0Q9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rapgef5Q8C0Q9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rapgef5Q8C0Q9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rapgef5Q8C0Q9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms