Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0E3

Trim47, Tripartite motif-containing protein 47, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim47Q8C0E3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim47Q8C0E3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim47Q8C0E3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim47Q8C0E3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim47Q8C0E3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim47Q8C0E3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim47Q8C0E3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim47Q8C0E3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim47Q8C0E3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim47Q8C0E3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim47Q8C0E3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim47Q8C0E3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim47Q8C0E3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim47Q8C0E3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim47Q8C0E3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim47Q8C0E3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Trim47Q8C0E3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Trim47Q8C0E3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim47Q8C0E3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim47Q8C0E3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim47Q8C0E3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim47Q8C0E3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim47Q8C0E3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim47Q8C0E3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim47Q8C0E3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim47Q8C0E3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim47Q8C0E3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim47Q8C0E3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim47Q8C0E3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim47Q8C0E3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim47Q8C0E3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim47Q8C0E3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim47Q8C0E3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim47Q8C0E3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim47Q8C0E3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim47Q8C0E3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim47Q8C0E3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim47Q8C0E3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim47Q8C0E3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim47Q8C0E3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim47Q8C0E3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim47Q8C0E3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim47Q8C0E3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim47Q8C0E3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim47Q8C0E3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim47Q8C0E3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim47Q8C0E3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim47Q8C0E3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim47Q8C0E3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim47Q8C0E3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim47Q8C0E3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim47Q8C0E3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim47Q8C0E3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim47Q8C0E3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim47Q8C0E3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim47Q8C0E3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim47Q8C0E3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim47Q8C0E3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim47Q8C0E3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim47Q8C0E3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim47Q8C0E3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim47Q8C0E3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim47Q8C0E3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim47Q8C0E3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim47Q8C0E3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim47Q8C0E3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim47Q8C0E3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim47Q8C0E3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trim47Q8C0E3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trim47Q8C0E3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trim47Q8C0E3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim47Q8C0E3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim47Q8C0E3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim47Q8C0E3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim47Q8C0E3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim47Q8C0E3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim47Q8C0E3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim47Q8C0E3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim47Q8C0E3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim47Q8C0E3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim47Q8C0E3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim47Q8C0E3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim47Q8C0E3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim47Q8C0E3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim47Q8C0E3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim47Q8C0E3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim47Q8C0E3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim47Q8C0E3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim47Q8C0E3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim47Q8C0E3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim47Q8C0E3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim47Q8C0E3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim47Q8C0E3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim47Q8C0E3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim47Q8C0E3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim47Q8C0E3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim47Q8C0E3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim47Q8C0E3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim47Q8C0E3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim47Q8C0E3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms