Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY02

Nkrf, NF-kappa-B-repressing factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NkrfQ8BY02 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NkrfQ8BY02 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NkrfQ8BY02 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NkrfQ8BY02 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NkrfQ8BY02 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NkrfQ8BY02 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NkrfQ8BY02 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NkrfQ8BY02 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NkrfQ8BY02 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NkrfQ8BY02 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NkrfQ8BY02 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NkrfQ8BY02 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NkrfQ8BY02 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NkrfQ8BY02 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NkrfQ8BY02 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NkrfQ8BY02 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NkrfQ8BY02 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NkrfQ8BY02 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NkrfQ8BY02 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NkrfQ8BY02 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NkrfQ8BY02 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NkrfQ8BY02 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NkrfQ8BY02 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NkrfQ8BY02 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NkrfQ8BY02 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NkrfQ8BY02 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NkrfQ8BY02 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NkrfQ8BY02 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NkrfQ8BY02 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NkrfQ8BY02 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NkrfQ8BY02 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NkrfQ8BY02 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NkrfQ8BY02 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NkrfQ8BY02 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NkrfQ8BY02 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NkrfQ8BY02 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NkrfQ8BY02 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NkrfQ8BY02 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NkrfQ8BY02 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NkrfQ8BY02 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NkrfQ8BY02 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NkrfQ8BY02 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NkrfQ8BY02 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NkrfQ8BY02 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NkrfQ8BY02 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NkrfQ8BY02 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NkrfQ8BY02 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NkrfQ8BY02 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NkrfQ8BY02 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NkrfQ8BY02 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NkrfQ8BY02 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NkrfQ8BY02 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NkrfQ8BY02 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NkrfQ8BY02 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NkrfQ8BY02 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NkrfQ8BY02 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NkrfQ8BY02 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NkrfQ8BY02 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NkrfQ8BY02 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NkrfQ8BY02 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NkrfQ8BY02 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NkrfQ8BY02 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NkrfQ8BY02 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NkrfQ8BY02 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NkrfQ8BY02 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NkrfQ8BY02 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NkrfQ8BY02 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NkrfQ8BY02 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NkrfQ8BY02 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NkrfQ8BY02 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NkrfQ8BY02 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NkrfQ8BY02 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NkrfQ8BY02 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NkrfQ8BY02 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NkrfQ8BY02 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NkrfQ8BY02 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NkrfQ8BY02 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NkrfQ8BY02 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NkrfQ8BY02 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NkrfQ8BY02 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NkrfQ8BY02 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NkrfQ8BY02 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NkrfQ8BY02 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NkrfQ8BY02 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NkrfQ8BY02 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NkrfQ8BY02 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NkrfQ8BY02 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NkrfQ8BY02 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NkrfQ8BY02 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NkrfQ8BY02 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NkrfQ8BY02 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NkrfQ8BY02 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NkrfQ8BY02 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NkrfQ8BY02 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NkrfQ8BY02 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NkrfQ8BY02 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NkrfQ8BY02 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NkrfQ8BY02 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NkrfQ8BY02 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NkrfQ8BY02 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms