Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ube3dQ8BX13 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube3dQ8BX13 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube3dQ8BX13 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube3dQ8BX13 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube3dQ8BX13 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube3dQ8BX13 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube3dQ8BX13 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube3dQ8BX13 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube3dQ8BX13 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube3dQ8BX13 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube3dQ8BX13 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube3dQ8BX13 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube3dQ8BX13 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube3dQ8BX13 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube3dQ8BX13 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube3dQ8BX13 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube3dQ8BX13 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube3dQ8BX13 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube3dQ8BX13 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube3dQ8BX13 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube3dQ8BX13 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube3dQ8BX13 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube3dQ8BX13 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube3dQ8BX13 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube3dQ8BX13 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube3dQ8BX13 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube3dQ8BX13 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube3dQ8BX13 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube3dQ8BX13 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube3dQ8BX13 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube3dQ8BX13 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube3dQ8BX13 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube3dQ8BX13 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube3dQ8BX13 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube3dQ8BX13 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube3dQ8BX13 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube3dQ8BX13 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube3dQ8BX13 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube3dQ8BX13 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube3dQ8BX13 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube3dQ8BX13 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube3dQ8BX13 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube3dQ8BX13 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube3dQ8BX13 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube3dQ8BX13 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube3dQ8BX13 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube3dQ8BX13 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube3dQ8BX13 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube3dQ8BX13 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube3dQ8BX13 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube3dQ8BX13 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube3dQ8BX13 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ube3dQ8BX13 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ube3dQ8BX13 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ube3dQ8BX13 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ube3dQ8BX13 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ube3dQ8BX13 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ube3dQ8BX13 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ube3dQ8BX13 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ube3dQ8BX13 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ube3dQ8BX13 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ube3dQ8BX13 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ube3dQ8BX13 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ube3dQ8BX13 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ube3dQ8BX13 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ube3dQ8BX13 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ube3dQ8BX13 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ube3dQ8BX13 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ube3dQ8BX13 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ube3dQ8BX13 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ube3dQ8BX13 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube3dQ8BX13 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube3dQ8BX13 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube3dQ8BX13 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube3dQ8BX13 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube3dQ8BX13 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube3dQ8BX13 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube3dQ8BX13 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube3dQ8BX13 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube3dQ8BX13 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ube3dQ8BX13 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ube3dQ8BX13 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ube3dQ8BX13 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ube3dQ8BX13 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ube3dQ8BX13 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ube3dQ8BX13 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube3dQ8BX13 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube3dQ8BX13 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube3dQ8BX13 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube3dQ8BX13 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube3dQ8BX13 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube3dQ8BX13 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube3dQ8BX13 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube3dQ8BX13 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ube3dQ8BX13 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ube3dQ8BX13 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ube3dQ8BX13 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ube3dQ8BX13 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ube3dQ8BX13 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms