Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV57

Ssc5d, Soluble scavenger receptor cysteine-rich domain-containing protein SSC5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssc5dQ8BV57 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ssc5dQ8BV57 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ssc5dQ8BV57 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Ssc5dQ8BV57 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ssc5dQ8BV57 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ssc5dQ8BV57 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ssc5dQ8BV57 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ssc5dQ8BV57 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ssc5dQ8BV57 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ssc5dQ8BV57 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ssc5dQ8BV57 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Ssc5dQ8BV57 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ssc5dQ8BV57 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ssc5dQ8BV57 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ssc5dQ8BV57 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ssc5dQ8BV57 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ssc5dQ8BV57 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ssc5dQ8BV57 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Ssc5dQ8BV57 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ssc5dQ8BV57 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ssc5dQ8BV57 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ssc5dQ8BV57 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ssc5dQ8BV57 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ssc5dQ8BV57 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Ssc5dQ8BV57 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ssc5dQ8BV57 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ssc5dQ8BV57 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ssc5dQ8BV57 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ssc5dQ8BV57 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ssc5dQ8BV57 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ssc5dQ8BV57 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ssc5dQ8BV57 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ssc5dQ8BV57 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ssc5dQ8BV57 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ssc5dQ8BV57 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ssc5dQ8BV57 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ssc5dQ8BV57 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ssc5dQ8BV57 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ssc5dQ8BV57 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ssc5dQ8BV57 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ssc5dQ8BV57 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Ssc5dQ8BV57 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ssc5dQ8BV57 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ssc5dQ8BV57 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ssc5dQ8BV57 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ssc5dQ8BV57 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ssc5dQ8BV57 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Ssc5dQ8BV57 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ssc5dQ8BV57 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ssc5dQ8BV57 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ssc5dQ8BV57 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ssc5dQ8BV57 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ssc5dQ8BV57 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ssc5dQ8BV57 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ssc5dQ8BV57 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ssc5dQ8BV57 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ssc5dQ8BV57 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Ssc5dQ8BV57 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ssc5dQ8BV57 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Ssc5dQ8BV57 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ssc5dQ8BV57 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ssc5dQ8BV57 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ssc5dQ8BV57 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ssc5dQ8BV57 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Ssc5dQ8BV57 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ssc5dQ8BV57 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ssc5dQ8BV57 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ssc5dQ8BV57 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ssc5dQ8BV57 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ssc5dQ8BV57 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ssc5dQ8BV57 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ssc5dQ8BV57 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ssc5dQ8BV57 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ssc5dQ8BV57 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ssc5dQ8BV57 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ssc5dQ8BV57 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ssc5dQ8BV57 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ssc5dQ8BV57 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ssc5dQ8BV57 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ssc5dQ8BV57 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Ssc5dQ8BV57 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Ssc5dQ8BV57 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ssc5dQ8BV57 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ssc5dQ8BV57 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ssc5dQ8BV57 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ssc5dQ8BV57 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ssc5dQ8BV57 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ssc5dQ8BV57 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ssc5dQ8BV57 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ssc5dQ8BV57 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Ssc5dQ8BV57 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ssc5dQ8BV57 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ssc5dQ8BV57 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ssc5dQ8BV57 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ssc5dQ8BV57 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ssc5dQ8BV57 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ssc5dQ8BV57 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ssc5dQ8BV57 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ssc5dQ8BV57 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ssc5dQ8BV57 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms