Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTW9

Pak4, Serine/threonine-protein kinase PAK 4, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pak4Q8BTW9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pak4Q8BTW9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Pak4Q8BTW9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pak4Q8BTW9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Pak4Q8BTW9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pak4Q8BTW9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pak4Q8BTW9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pak4Q8BTW9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pak4Q8BTW9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Pak4Q8BTW9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pak4Q8BTW9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pak4Q8BTW9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Pak4Q8BTW9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Pak4Q8BTW9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pak4Q8BTW9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pak4Q8BTW9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pak4Q8BTW9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pak4Q8BTW9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pak4Q8BTW9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pak4Q8BTW9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pak4Q8BTW9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pak4Q8BTW9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pak4Q8BTW9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pak4Q8BTW9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pak4Q8BTW9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Pak4Q8BTW9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Pak4Q8BTW9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pak4Q8BTW9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Pak4Q8BTW9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pak4Q8BTW9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pak4Q8BTW9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pak4Q8BTW9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Pak4Q8BTW9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pak4Q8BTW9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pak4Q8BTW9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
Pak4Q8BTW9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pak4Q8BTW9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pak4Q8BTW9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
Pak4Q8BTW9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pak4Q8BTW9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Pak4Q8BTW9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Pak4Q8BTW9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pak4Q8BTW9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Pak4Q8BTW9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pak4Q8BTW9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pak4Q8BTW9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pak4Q8BTW9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pak4Q8BTW9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pak4Q8BTW9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pak4Q8BTW9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pak4Q8BTW9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pak4Q8BTW9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pak4Q8BTW9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pak4Q8BTW9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pak4Q8BTW9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Pak4Q8BTW9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pak4Q8BTW9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pak4Q8BTW9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pak4Q8BTW9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Pak4Q8BTW9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pak4Q8BTW9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pak4Q8BTW9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pak4Q8BTW9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pak4Q8BTW9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Pak4Q8BTW9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Pak4Q8BTW9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pak4Q8BTW9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pak4Q8BTW9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pak4Q8BTW9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pak4Q8BTW9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pak4Q8BTW9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pak4Q8BTW9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Pak4Q8BTW9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pak4Q8BTW9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pak4Q8BTW9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pak4Q8BTW9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pak4Q8BTW9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pak4Q8BTW9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pak4Q8BTW9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pak4Q8BTW9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pak4Q8BTW9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pak4Q8BTW9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pak4Q8BTW9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pak4Q8BTW9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pak4Q8BTW9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pak4Q8BTW9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pak4Q8BTW9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Pak4Q8BTW9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pak4Q8BTW9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pak4Q8BTW9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pak4Q8BTW9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pak4Q8BTW9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pak4Q8BTW9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pak4Q8BTW9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pak4Q8BTW9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pak4Q8BTW9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pak4Q8BTW9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pak4Q8BTW9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pak4Q8BTW9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pak4Q8BTW9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms