Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSF5

Klhl38, Kelch-like protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl38Q8BSF5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Klhl38Q8BSF5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Klhl38Q8BSF5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Klhl38Q8BSF5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Klhl38Q8BSF5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Klhl38Q8BSF5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Klhl38Q8BSF5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Klhl38Q8BSF5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Klhl38Q8BSF5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Klhl38Q8BSF5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Klhl38Q8BSF5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Klhl38Q8BSF5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Klhl38Q8BSF5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Klhl38Q8BSF5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Klhl38Q8BSF5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Klhl38Q8BSF5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Klhl38Q8BSF5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Klhl38Q8BSF5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Klhl38Q8BSF5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Klhl38Q8BSF5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Klhl38Q8BSF5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Klhl38Q8BSF5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Klhl38Q8BSF5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Klhl38Q8BSF5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Klhl38Q8BSF5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Klhl38Q8BSF5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Klhl38Q8BSF5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Klhl38Q8BSF5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Klhl38Q8BSF5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Klhl38Q8BSF5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Klhl38Q8BSF5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Klhl38Q8BSF5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Klhl38Q8BSF5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Klhl38Q8BSF5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Klhl38Q8BSF5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Klhl38Q8BSF5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Klhl38Q8BSF5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Klhl38Q8BSF5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Klhl38Q8BSF5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Klhl38Q8BSF5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Klhl38Q8BSF5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Klhl38Q8BSF5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Klhl38Q8BSF5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Klhl38Q8BSF5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Klhl38Q8BSF5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Klhl38Q8BSF5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Klhl38Q8BSF5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Klhl38Q8BSF5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Klhl38Q8BSF5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Klhl38Q8BSF5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Klhl38Q8BSF5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Klhl38Q8BSF5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Klhl38Q8BSF5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Klhl38Q8BSF5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Klhl38Q8BSF5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Klhl38Q8BSF5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Klhl38Q8BSF5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Klhl38Q8BSF5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Klhl38Q8BSF5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Klhl38Q8BSF5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Klhl38Q8BSF5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Klhl38Q8BSF5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Klhl38Q8BSF5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klhl38Q8BSF5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klhl38Q8BSF5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klhl38Q8BSF5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klhl38Q8BSF5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klhl38Q8BSF5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klhl38Q8BSF5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Klhl38Q8BSF5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klhl38Q8BSF5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Klhl38Q8BSF5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klhl38Q8BSF5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klhl38Q8BSF5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klhl38Q8BSF5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klhl38Q8BSF5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Klhl38Q8BSF5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Klhl38Q8BSF5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Klhl38Q8BSF5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Klhl38Q8BSF5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Klhl38Q8BSF5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Klhl38Q8BSF5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Klhl38Q8BSF5 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Klhl38Q8BSF5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Klhl38Q8BSF5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Klhl38Q8BSF5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Klhl38Q8BSF5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Klhl38Q8BSF5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Klhl38Q8BSF5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Klhl38Q8BSF5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Klhl38Q8BSF5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Klhl38Q8BSF5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Klhl38Q8BSF5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Klhl38Q8BSF5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Klhl38Q8BSF5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Klhl38Q8BSF5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Klhl38Q8BSF5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Klhl38Q8BSF5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Klhl38Q8BSF5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Klhl38Q8BSF5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms