Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQ33

Ticrr, Treslin, mousemouse

Predictions only

Length 1,889 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TicrrQ8BQ33 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TicrrQ8BQ33 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TicrrQ8BQ33 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TicrrQ8BQ33 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TicrrQ8BQ33 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TicrrQ8BQ33 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TicrrQ8BQ33 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TicrrQ8BQ33 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TicrrQ8BQ33 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TicrrQ8BQ33 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TicrrQ8BQ33 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TicrrQ8BQ33 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TicrrQ8BQ33 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TicrrQ8BQ33 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TicrrQ8BQ33 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TicrrQ8BQ33 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TicrrQ8BQ33 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TicrrQ8BQ33 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TicrrQ8BQ33 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TicrrQ8BQ33 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TicrrQ8BQ33 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TicrrQ8BQ33 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TicrrQ8BQ33 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TicrrQ8BQ33 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TicrrQ8BQ33 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TicrrQ8BQ33 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TicrrQ8BQ33 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TicrrQ8BQ33 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TicrrQ8BQ33 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TicrrQ8BQ33 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TicrrQ8BQ33 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TicrrQ8BQ33 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TicrrQ8BQ33 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TicrrQ8BQ33 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TicrrQ8BQ33 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TicrrQ8BQ33 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TicrrQ8BQ33 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TicrrQ8BQ33 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TicrrQ8BQ33 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TicrrQ8BQ33 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TicrrQ8BQ33 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TicrrQ8BQ33 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TicrrQ8BQ33 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TicrrQ8BQ33 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TicrrQ8BQ33 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TicrrQ8BQ33 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TicrrQ8BQ33 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TicrrQ8BQ33 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TicrrQ8BQ33 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TicrrQ8BQ33 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TicrrQ8BQ33 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TicrrQ8BQ33 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TicrrQ8BQ33 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TicrrQ8BQ33 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TicrrQ8BQ33 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TicrrQ8BQ33 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TicrrQ8BQ33 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TicrrQ8BQ33 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TicrrQ8BQ33 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TicrrQ8BQ33 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TicrrQ8BQ33 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TicrrQ8BQ33 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TicrrQ8BQ33 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TicrrQ8BQ33 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TicrrQ8BQ33 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TicrrQ8BQ33 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TicrrQ8BQ33 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TicrrQ8BQ33 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TicrrQ8BQ33 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TicrrQ8BQ33 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TicrrQ8BQ33 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TicrrQ8BQ33 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TicrrQ8BQ33 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TicrrQ8BQ33 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TicrrQ8BQ33 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TicrrQ8BQ33 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TicrrQ8BQ33 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TicrrQ8BQ33 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TicrrQ8BQ33 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TicrrQ8BQ33 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TicrrQ8BQ33 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TicrrQ8BQ33 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TicrrQ8BQ33 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TicrrQ8BQ33 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TicrrQ8BQ33 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TicrrQ8BQ33 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TicrrQ8BQ33 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TicrrQ8BQ33 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TicrrQ8BQ33 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TicrrQ8BQ33 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TicrrQ8BQ33 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TicrrQ8BQ33 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TicrrQ8BQ33 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TicrrQ8BQ33 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TicrrQ8BQ33 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TicrrQ8BQ33 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TicrrQ8BQ33 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TicrrQ8BQ33 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TicrrQ8BQ33 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TicrrQ8BQ33 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms