Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKI2

Tnrc6b, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6bQ8BKI2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
Tnrc6bQ8BKI2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Tnrc6bQ8BKI2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Tnrc6bQ8BKI2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tnrc6bQ8BKI2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tnrc6bQ8BKI2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tnrc6bQ8BKI2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tnrc6bQ8BKI2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tnrc6bQ8BKI2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tnrc6bQ8BKI2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tnrc6bQ8BKI2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tnrc6bQ8BKI2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tnrc6bQ8BKI2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tnrc6bQ8BKI2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tnrc6bQ8BKI2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tnrc6bQ8BKI2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tnrc6bQ8BKI2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tnrc6bQ8BKI2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tnrc6bQ8BKI2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tnrc6bQ8BKI2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tnrc6bQ8BKI2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tnrc6bQ8BKI2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tnrc6bQ8BKI2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tnrc6bQ8BKI2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Tnrc6bQ8BKI2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tnrc6bQ8BKI2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tnrc6bQ8BKI2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tnrc6bQ8BKI2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tnrc6bQ8BKI2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tnrc6bQ8BKI2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tnrc6bQ8BKI2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tnrc6bQ8BKI2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tnrc6bQ8BKI2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Tnrc6bQ8BKI2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tnrc6bQ8BKI2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tnrc6bQ8BKI2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tnrc6bQ8BKI2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tnrc6bQ8BKI2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Tnrc6bQ8BKI2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tnrc6bQ8BKI2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tnrc6bQ8BKI2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tnrc6bQ8BKI2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tnrc6bQ8BKI2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tnrc6bQ8BKI2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tnrc6bQ8BKI2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tnrc6bQ8BKI2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tnrc6bQ8BKI2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Tnrc6bQ8BKI2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tnrc6bQ8BKI2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tnrc6bQ8BKI2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tnrc6bQ8BKI2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tnrc6bQ8BKI2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tnrc6bQ8BKI2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tnrc6bQ8BKI2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tnrc6bQ8BKI2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tnrc6bQ8BKI2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tnrc6bQ8BKI2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tnrc6bQ8BKI2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tnrc6bQ8BKI2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tnrc6bQ8BKI2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tnrc6bQ8BKI2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Tnrc6bQ8BKI2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tnrc6bQ8BKI2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tnrc6bQ8BKI2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tnrc6bQ8BKI2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Tnrc6bQ8BKI2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tnrc6bQ8BKI2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tnrc6bQ8BKI2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tnrc6bQ8BKI2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Tnrc6bQ8BKI2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Tnrc6bQ8BKI2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Tnrc6bQ8BKI2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tnrc6bQ8BKI2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tnrc6bQ8BKI2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tnrc6bQ8BKI2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tnrc6bQ8BKI2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tnrc6bQ8BKI2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tnrc6bQ8BKI2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tnrc6bQ8BKI2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tnrc6bQ8BKI2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tnrc6bQ8BKI2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tnrc6bQ8BKI2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tnrc6bQ8BKI2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Tnrc6bQ8BKI2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tnrc6bQ8BKI2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tnrc6bQ8BKI2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tnrc6bQ8BKI2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Tnrc6bQ8BKI2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tnrc6bQ8BKI2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tnrc6bQ8BKI2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tnrc6bQ8BKI2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tnrc6bQ8BKI2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tnrc6bQ8BKI2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tnrc6bQ8BKI2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tnrc6bQ8BKI2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tnrc6bQ8BKI2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tnrc6bQ8BKI2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tnrc6bQ8BKI2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tnrc6bQ8BKI2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tnrc6bQ8BKI2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms