Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJN4

Fndc9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc9Q8BJN4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fndc9Q8BJN4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fndc9Q8BJN4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fndc9Q8BJN4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fndc9Q8BJN4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fndc9Q8BJN4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fndc9Q8BJN4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Fndc9Q8BJN4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fndc9Q8BJN4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fndc9Q8BJN4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fndc9Q8BJN4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fndc9Q8BJN4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fndc9Q8BJN4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fndc9Q8BJN4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fndc9Q8BJN4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fndc9Q8BJN4 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fndc9Q8BJN4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fndc9Q8BJN4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fndc9Q8BJN4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fndc9Q8BJN4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Fndc9Q8BJN4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fndc9Q8BJN4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fndc9Q8BJN4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fndc9Q8BJN4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fndc9Q8BJN4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fndc9Q8BJN4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fndc9Q8BJN4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fndc9Q8BJN4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fndc9Q8BJN4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fndc9Q8BJN4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fndc9Q8BJN4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fndc9Q8BJN4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fndc9Q8BJN4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fndc9Q8BJN4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fndc9Q8BJN4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fndc9Q8BJN4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fndc9Q8BJN4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fndc9Q8BJN4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fndc9Q8BJN4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fndc9Q8BJN4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fndc9Q8BJN4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fndc9Q8BJN4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fndc9Q8BJN4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fndc9Q8BJN4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fndc9Q8BJN4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fndc9Q8BJN4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fndc9Q8BJN4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fndc9Q8BJN4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fndc9Q8BJN4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fndc9Q8BJN4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fndc9Q8BJN4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fndc9Q8BJN4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fndc9Q8BJN4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fndc9Q8BJN4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fndc9Q8BJN4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fndc9Q8BJN4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fndc9Q8BJN4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fndc9Q8BJN4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fndc9Q8BJN4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fndc9Q8BJN4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fndc9Q8BJN4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fndc9Q8BJN4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fndc9Q8BJN4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fndc9Q8BJN4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fndc9Q8BJN4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fndc9Q8BJN4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fndc9Q8BJN4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fndc9Q8BJN4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fndc9Q8BJN4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fndc9Q8BJN4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fndc9Q8BJN4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fndc9Q8BJN4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fndc9Q8BJN4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fndc9Q8BJN4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fndc9Q8BJN4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fndc9Q8BJN4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fndc9Q8BJN4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fndc9Q8BJN4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fndc9Q8BJN4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fndc9Q8BJN4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fndc9Q8BJN4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fndc9Q8BJN4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fndc9Q8BJN4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fndc9Q8BJN4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fndc9Q8BJN4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fndc9Q8BJN4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fndc9Q8BJN4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fndc9Q8BJN4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fndc9Q8BJN4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fndc9Q8BJN4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fndc9Q8BJN4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fndc9Q8BJN4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fndc9Q8BJN4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fndc9Q8BJN4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Fndc9Q8BJN4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fndc9Q8BJN4 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fndc9Q8BJN4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fndc9Q8BJN4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fndc9Q8BJN4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fndc9Q8BJN4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms