Protein–RNA interactions for Protein: Q8BII3

D130040H23Rik, RIKEN cDNA D130040H23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130040H23RikQ8BII3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
D130040H23RikQ8BII3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
D130040H23RikQ8BII3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
D130040H23RikQ8BII3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
D130040H23RikQ8BII3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
D130040H23RikQ8BII3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
D130040H23RikQ8BII3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
D130040H23RikQ8BII3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
D130040H23RikQ8BII3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
D130040H23RikQ8BII3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
D130040H23RikQ8BII3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
D130040H23RikQ8BII3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
D130040H23RikQ8BII3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
D130040H23RikQ8BII3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
D130040H23RikQ8BII3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
D130040H23RikQ8BII3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
D130040H23RikQ8BII3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
D130040H23RikQ8BII3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
D130040H23RikQ8BII3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
D130040H23RikQ8BII3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
D130040H23RikQ8BII3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
D130040H23RikQ8BII3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
D130040H23RikQ8BII3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
D130040H23RikQ8BII3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
D130040H23RikQ8BII3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
D130040H23RikQ8BII3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
D130040H23RikQ8BII3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
D130040H23RikQ8BII3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
D130040H23RikQ8BII3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
D130040H23RikQ8BII3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
D130040H23RikQ8BII3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
D130040H23RikQ8BII3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
D130040H23RikQ8BII3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
D130040H23RikQ8BII3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
D130040H23RikQ8BII3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
D130040H23RikQ8BII3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
D130040H23RikQ8BII3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
D130040H23RikQ8BII3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
D130040H23RikQ8BII3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
D130040H23RikQ8BII3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
D130040H23RikQ8BII3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
D130040H23RikQ8BII3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
D130040H23RikQ8BII3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
D130040H23RikQ8BII3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
D130040H23RikQ8BII3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
D130040H23RikQ8BII3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
D130040H23RikQ8BII3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
D130040H23RikQ8BII3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
D130040H23RikQ8BII3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
D130040H23RikQ8BII3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
D130040H23RikQ8BII3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
D130040H23RikQ8BII3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
D130040H23RikQ8BII3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
D130040H23RikQ8BII3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
D130040H23RikQ8BII3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
D130040H23RikQ8BII3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
D130040H23RikQ8BII3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
D130040H23RikQ8BII3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
D130040H23RikQ8BII3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
D130040H23RikQ8BII3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
D130040H23RikQ8BII3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
D130040H23RikQ8BII3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
D130040H23RikQ8BII3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
D130040H23RikQ8BII3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
D130040H23RikQ8BII3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
D130040H23RikQ8BII3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
D130040H23RikQ8BII3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
D130040H23RikQ8BII3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
D130040H23RikQ8BII3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
D130040H23RikQ8BII3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
D130040H23RikQ8BII3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
D130040H23RikQ8BII3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
D130040H23RikQ8BII3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
D130040H23RikQ8BII3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
D130040H23RikQ8BII3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
D130040H23RikQ8BII3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
D130040H23RikQ8BII3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
D130040H23RikQ8BII3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
D130040H23RikQ8BII3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
D130040H23RikQ8BII3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
D130040H23RikQ8BII3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
D130040H23RikQ8BII3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
D130040H23RikQ8BII3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
D130040H23RikQ8BII3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
D130040H23RikQ8BII3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
D130040H23RikQ8BII3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
D130040H23RikQ8BII3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
D130040H23RikQ8BII3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
D130040H23RikQ8BII3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
D130040H23RikQ8BII3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
D130040H23RikQ8BII3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
D130040H23RikQ8BII3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
D130040H23RikQ8BII3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
D130040H23RikQ8BII3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
D130040H23RikQ8BII3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
D130040H23RikQ8BII3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
D130040H23RikQ8BII3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
D130040H23RikQ8BII3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
D130040H23RikQ8BII3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
D130040H23RikQ8BII3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms