Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIF2

Rbfox3, RNA binding protein fox-1 homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbfox3Q8BIF2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbfox3Q8BIF2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbfox3Q8BIF2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbfox3Q8BIF2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbfox3Q8BIF2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbfox3Q8BIF2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbfox3Q8BIF2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbfox3Q8BIF2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbfox3Q8BIF2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbfox3Q8BIF2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbfox3Q8BIF2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbfox3Q8BIF2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbfox3Q8BIF2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbfox3Q8BIF2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbfox3Q8BIF2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbfox3Q8BIF2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbfox3Q8BIF2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbfox3Q8BIF2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbfox3Q8BIF2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbfox3Q8BIF2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbfox3Q8BIF2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbfox3Q8BIF2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbfox3Q8BIF2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbfox3Q8BIF2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbfox3Q8BIF2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbfox3Q8BIF2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbfox3Q8BIF2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbfox3Q8BIF2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbfox3Q8BIF2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbfox3Q8BIF2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbfox3Q8BIF2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbfox3Q8BIF2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbfox3Q8BIF2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbfox3Q8BIF2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbfox3Q8BIF2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbfox3Q8BIF2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbfox3Q8BIF2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbfox3Q8BIF2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbfox3Q8BIF2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbfox3Q8BIF2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbfox3Q8BIF2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbfox3Q8BIF2 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbfox3Q8BIF2 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbfox3Q8BIF2 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbfox3Q8BIF2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbfox3Q8BIF2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbfox3Q8BIF2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbfox3Q8BIF2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbfox3Q8BIF2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbfox3Q8BIF2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbfox3Q8BIF2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbfox3Q8BIF2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbfox3Q8BIF2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbfox3Q8BIF2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbfox3Q8BIF2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbfox3Q8BIF2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbfox3Q8BIF2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbfox3Q8BIF2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbfox3Q8BIF2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbfox3Q8BIF2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbfox3Q8BIF2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbfox3Q8BIF2 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbfox3Q8BIF2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rbfox3Q8BIF2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rbfox3Q8BIF2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rbfox3Q8BIF2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbfox3Q8BIF2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbfox3Q8BIF2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbfox3Q8BIF2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbfox3Q8BIF2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbfox3Q8BIF2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbfox3Q8BIF2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbfox3Q8BIF2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbfox3Q8BIF2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbfox3Q8BIF2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbfox3Q8BIF2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbfox3Q8BIF2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbfox3Q8BIF2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbfox3Q8BIF2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbfox3Q8BIF2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbfox3Q8BIF2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbfox3Q8BIF2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbfox3Q8BIF2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbfox3Q8BIF2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbfox3Q8BIF2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbfox3Q8BIF2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbfox3Q8BIF2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbfox3Q8BIF2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbfox3Q8BIF2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbfox3Q8BIF2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbfox3Q8BIF2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbfox3Q8BIF2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbfox3Q8BIF2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbfox3Q8BIF2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbfox3Q8BIF2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbfox3Q8BIF2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbfox3Q8BIF2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbfox3Q8BIF2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbfox3Q8BIF2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbfox3Q8BIF2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms