Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH75

Rnf41, E3 ubiquitin-protein ligase NRDP1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf41Q8BH75 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rnf41Q8BH75 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rnf41Q8BH75 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rnf41Q8BH75 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rnf41Q8BH75 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rnf41Q8BH75 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rnf41Q8BH75 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rnf41Q8BH75 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rnf41Q8BH75 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rnf41Q8BH75 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rnf41Q8BH75 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rnf41Q8BH75 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rnf41Q8BH75 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rnf41Q8BH75 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rnf41Q8BH75 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rnf41Q8BH75 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rnf41Q8BH75 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rnf41Q8BH75 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rnf41Q8BH75 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rnf41Q8BH75 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rnf41Q8BH75 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rnf41Q8BH75 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rnf41Q8BH75 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rnf41Q8BH75 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rnf41Q8BH75 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rnf41Q8BH75 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rnf41Q8BH75 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rnf41Q8BH75 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rnf41Q8BH75 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rnf41Q8BH75 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rnf41Q8BH75 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rnf41Q8BH75 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rnf41Q8BH75 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rnf41Q8BH75 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rnf41Q8BH75 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Rnf41Q8BH75 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rnf41Q8BH75 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rnf41Q8BH75 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rnf41Q8BH75 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rnf41Q8BH75 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rnf41Q8BH75 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rnf41Q8BH75 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rnf41Q8BH75 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rnf41Q8BH75 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rnf41Q8BH75 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rnf41Q8BH75 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rnf41Q8BH75 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rnf41Q8BH75 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Rnf41Q8BH75 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rnf41Q8BH75 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rnf41Q8BH75 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Rnf41Q8BH75 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rnf41Q8BH75 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rnf41Q8BH75 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rnf41Q8BH75 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rnf41Q8BH75 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rnf41Q8BH75 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Rnf41Q8BH75 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rnf41Q8BH75 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rnf41Q8BH75 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rnf41Q8BH75 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rnf41Q8BH75 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Rnf41Q8BH75 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rnf41Q8BH75 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rnf41Q8BH75 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rnf41Q8BH75 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rnf41Q8BH75 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rnf41Q8BH75 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rnf41Q8BH75 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rnf41Q8BH75 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rnf41Q8BH75 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rnf41Q8BH75 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rnf41Q8BH75 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rnf41Q8BH75 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rnf41Q8BH75 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rnf41Q8BH75 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Rnf41Q8BH75 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rnf41Q8BH75 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rnf41Q8BH75 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Rnf41Q8BH75 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rnf41Q8BH75 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rnf41Q8BH75 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rnf41Q8BH75 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rnf41Q8BH75 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rnf41Q8BH75 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rnf41Q8BH75 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rnf41Q8BH75 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rnf41Q8BH75 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rnf41Q8BH75 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rnf41Q8BH75 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rnf41Q8BH75 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rnf41Q8BH75 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Rnf41Q8BH75 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rnf41Q8BH75 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rnf41Q8BH75 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rnf41Q8BH75 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rnf41Q8BH75 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rnf41Q8BH75 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rnf41Q8BH75 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rnf41Q8BH75 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms