Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH01

Tmco3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco3Q8BH01 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmco3Q8BH01 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmco3Q8BH01 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmco3Q8BH01 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmco3Q8BH01 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmco3Q8BH01 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmco3Q8BH01 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmco3Q8BH01 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmco3Q8BH01 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmco3Q8BH01 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmco3Q8BH01 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmco3Q8BH01 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmco3Q8BH01 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmco3Q8BH01 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmco3Q8BH01 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmco3Q8BH01 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmco3Q8BH01 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmco3Q8BH01 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmco3Q8BH01 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmco3Q8BH01 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmco3Q8BH01 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmco3Q8BH01 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmco3Q8BH01 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmco3Q8BH01 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmco3Q8BH01 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmco3Q8BH01 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmco3Q8BH01 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmco3Q8BH01 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmco3Q8BH01 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmco3Q8BH01 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmco3Q8BH01 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmco3Q8BH01 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmco3Q8BH01 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmco3Q8BH01 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmco3Q8BH01 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmco3Q8BH01 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmco3Q8BH01 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmco3Q8BH01 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmco3Q8BH01 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmco3Q8BH01 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmco3Q8BH01 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmco3Q8BH01 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmco3Q8BH01 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmco3Q8BH01 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmco3Q8BH01 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tmco3Q8BH01 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tmco3Q8BH01 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmco3Q8BH01 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmco3Q8BH01 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmco3Q8BH01 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmco3Q8BH01 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmco3Q8BH01 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmco3Q8BH01 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmco3Q8BH01 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmco3Q8BH01 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmco3Q8BH01 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmco3Q8BH01 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmco3Q8BH01 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmco3Q8BH01 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmco3Q8BH01 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmco3Q8BH01 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmco3Q8BH01 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmco3Q8BH01 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmco3Q8BH01 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmco3Q8BH01 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmco3Q8BH01 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmco3Q8BH01 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmco3Q8BH01 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmco3Q8BH01 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmco3Q8BH01 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmco3Q8BH01 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmco3Q8BH01 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmco3Q8BH01 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmco3Q8BH01 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmco3Q8BH01 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmco3Q8BH01 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmco3Q8BH01 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmco3Q8BH01 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmco3Q8BH01 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmco3Q8BH01 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmco3Q8BH01 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmco3Q8BH01 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmco3Q8BH01 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmco3Q8BH01 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmco3Q8BH01 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmco3Q8BH01 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmco3Q8BH01 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmco3Q8BH01 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmco3Q8BH01 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmco3Q8BH01 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmco3Q8BH01 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmco3Q8BH01 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmco3Q8BH01 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmco3Q8BH01 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmco3Q8BH01 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmco3Q8BH01 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmco3Q8BH01 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmco3Q8BH01 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmco3Q8BH01 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmco3Q8BH01 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms