Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGX2

Timm29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm29Q8BGX2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Timm29Q8BGX2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Timm29Q8BGX2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Timm29Q8BGX2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Timm29Q8BGX2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Timm29Q8BGX2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Timm29Q8BGX2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Timm29Q8BGX2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Timm29Q8BGX2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Timm29Q8BGX2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Timm29Q8BGX2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Timm29Q8BGX2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Timm29Q8BGX2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Timm29Q8BGX2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Timm29Q8BGX2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Timm29Q8BGX2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Timm29Q8BGX2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Timm29Q8BGX2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Timm29Q8BGX2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Timm29Q8BGX2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Timm29Q8BGX2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Timm29Q8BGX2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Timm29Q8BGX2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Timm29Q8BGX2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Timm29Q8BGX2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Timm29Q8BGX2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Timm29Q8BGX2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Timm29Q8BGX2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Timm29Q8BGX2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Timm29Q8BGX2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Timm29Q8BGX2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Timm29Q8BGX2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Timm29Q8BGX2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Timm29Q8BGX2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Timm29Q8BGX2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Timm29Q8BGX2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Timm29Q8BGX2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Timm29Q8BGX2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Timm29Q8BGX2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Timm29Q8BGX2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Timm29Q8BGX2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Timm29Q8BGX2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Timm29Q8BGX2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Timm29Q8BGX2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Timm29Q8BGX2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Timm29Q8BGX2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Timm29Q8BGX2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Timm29Q8BGX2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Timm29Q8BGX2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Timm29Q8BGX2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Timm29Q8BGX2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Timm29Q8BGX2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Timm29Q8BGX2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Timm29Q8BGX2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Timm29Q8BGX2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Timm29Q8BGX2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Timm29Q8BGX2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Timm29Q8BGX2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Timm29Q8BGX2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Timm29Q8BGX2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Timm29Q8BGX2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Timm29Q8BGX2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Timm29Q8BGX2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Timm29Q8BGX2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Timm29Q8BGX2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Timm29Q8BGX2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Timm29Q8BGX2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Timm29Q8BGX2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Timm29Q8BGX2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Timm29Q8BGX2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Timm29Q8BGX2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Timm29Q8BGX2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Timm29Q8BGX2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Timm29Q8BGX2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Timm29Q8BGX2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Timm29Q8BGX2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Timm29Q8BGX2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Timm29Q8BGX2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Timm29Q8BGX2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Timm29Q8BGX2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Timm29Q8BGX2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Timm29Q8BGX2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Timm29Q8BGX2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Timm29Q8BGX2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Timm29Q8BGX2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Timm29Q8BGX2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Timm29Q8BGX2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Timm29Q8BGX2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Timm29Q8BGX2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Timm29Q8BGX2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Timm29Q8BGX2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Timm29Q8BGX2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Timm29Q8BGX2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Timm29Q8BGX2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Timm29Q8BGX2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Timm29Q8BGX2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Timm29Q8BGX2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Timm29Q8BGX2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Timm29Q8BGX2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Timm29Q8BGX2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms