Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ubash3bQ8BGG7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ubash3bQ8BGG7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ubash3bQ8BGG7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ubash3bQ8BGG7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ubash3bQ8BGG7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ubash3bQ8BGG7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ubash3bQ8BGG7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ubash3bQ8BGG7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ubash3bQ8BGG7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ubash3bQ8BGG7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ubash3bQ8BGG7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ubash3bQ8BGG7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ubash3bQ8BGG7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ubash3bQ8BGG7 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ubash3bQ8BGG7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ubash3bQ8BGG7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ubash3bQ8BGG7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ubash3bQ8BGG7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ubash3bQ8BGG7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ubash3bQ8BGG7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ubash3bQ8BGG7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ubash3bQ8BGG7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ubash3bQ8BGG7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ubash3bQ8BGG7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ubash3bQ8BGG7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ubash3bQ8BGG7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ubash3bQ8BGG7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ubash3bQ8BGG7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ubash3bQ8BGG7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ubash3bQ8BGG7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ubash3bQ8BGG7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ubash3bQ8BGG7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ubash3bQ8BGG7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ubash3bQ8BGG7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ubash3bQ8BGG7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ubash3bQ8BGG7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ubash3bQ8BGG7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ubash3bQ8BGG7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ubash3bQ8BGG7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ubash3bQ8BGG7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ubash3bQ8BGG7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ubash3bQ8BGG7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ubash3bQ8BGG7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ubash3bQ8BGG7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ubash3bQ8BGG7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ubash3bQ8BGG7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ubash3bQ8BGG7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ubash3bQ8BGG7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ubash3bQ8BGG7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ubash3bQ8BGG7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubash3bQ8BGG7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubash3bQ8BGG7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubash3bQ8BGG7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubash3bQ8BGG7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubash3bQ8BGG7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubash3bQ8BGG7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubash3bQ8BGG7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubash3bQ8BGG7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubash3bQ8BGG7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubash3bQ8BGG7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubash3bQ8BGG7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubash3bQ8BGG7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubash3bQ8BGG7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubash3bQ8BGG7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubash3bQ8BGG7 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubash3bQ8BGG7 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubash3bQ8BGG7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubash3bQ8BGG7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubash3bQ8BGG7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubash3bQ8BGG7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubash3bQ8BGG7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubash3bQ8BGG7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubash3bQ8BGG7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ubash3bQ8BGG7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ubash3bQ8BGG7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ubash3bQ8BGG7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ubash3bQ8BGG7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ubash3bQ8BGG7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ubash3bQ8BGG7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ubash3bQ8BGG7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ubash3bQ8BGG7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ubash3bQ8BGG7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ubash3bQ8BGG7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ubash3bQ8BGG7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubash3bQ8BGG7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubash3bQ8BGG7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubash3bQ8BGG7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubash3bQ8BGG7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubash3bQ8BGG7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubash3bQ8BGG7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubash3bQ8BGG7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubash3bQ8BGG7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubash3bQ8BGG7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubash3bQ8BGG7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubash3bQ8BGG7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ubash3bQ8BGG7 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ubash3bQ8BGG7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ubash3bQ8BGG7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.5 ms