Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFW4

Trim65, Tripartite motif-containing protein 65, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim65Q8BFW4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim65Q8BFW4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim65Q8BFW4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim65Q8BFW4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim65Q8BFW4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim65Q8BFW4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim65Q8BFW4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim65Q8BFW4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim65Q8BFW4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim65Q8BFW4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim65Q8BFW4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim65Q8BFW4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim65Q8BFW4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim65Q8BFW4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim65Q8BFW4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim65Q8BFW4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim65Q8BFW4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim65Q8BFW4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim65Q8BFW4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim65Q8BFW4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim65Q8BFW4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim65Q8BFW4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim65Q8BFW4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim65Q8BFW4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim65Q8BFW4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim65Q8BFW4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim65Q8BFW4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim65Q8BFW4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim65Q8BFW4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trim65Q8BFW4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trim65Q8BFW4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim65Q8BFW4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim65Q8BFW4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim65Q8BFW4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim65Q8BFW4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim65Q8BFW4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim65Q8BFW4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim65Q8BFW4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim65Q8BFW4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim65Q8BFW4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim65Q8BFW4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim65Q8BFW4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim65Q8BFW4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim65Q8BFW4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim65Q8BFW4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim65Q8BFW4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim65Q8BFW4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim65Q8BFW4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim65Q8BFW4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim65Q8BFW4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim65Q8BFW4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim65Q8BFW4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim65Q8BFW4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim65Q8BFW4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim65Q8BFW4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim65Q8BFW4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim65Q8BFW4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim65Q8BFW4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim65Q8BFW4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim65Q8BFW4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim65Q8BFW4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim65Q8BFW4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim65Q8BFW4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim65Q8BFW4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim65Q8BFW4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim65Q8BFW4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim65Q8BFW4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim65Q8BFW4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim65Q8BFW4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim65Q8BFW4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim65Q8BFW4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim65Q8BFW4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim65Q8BFW4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim65Q8BFW4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim65Q8BFW4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim65Q8BFW4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim65Q8BFW4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim65Q8BFW4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim65Q8BFW4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim65Q8BFW4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim65Q8BFW4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim65Q8BFW4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim65Q8BFW4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim65Q8BFW4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim65Q8BFW4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim65Q8BFW4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim65Q8BFW4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim65Q8BFW4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim65Q8BFW4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim65Q8BFW4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim65Q8BFW4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim65Q8BFW4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trim65Q8BFW4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trim65Q8BFW4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trim65Q8BFW4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trim65Q8BFW4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim65Q8BFW4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim65Q8BFW4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim65Q8BFW4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim65Q8BFW4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms