Protein–RNA interactions for Protein: Q80XU8

Lrfn4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn4Q80XU8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrfn4Q80XU8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrfn4Q80XU8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrfn4Q80XU8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrfn4Q80XU8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrfn4Q80XU8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrfn4Q80XU8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrfn4Q80XU8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrfn4Q80XU8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrfn4Q80XU8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrfn4Q80XU8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrfn4Q80XU8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrfn4Q80XU8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrfn4Q80XU8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrfn4Q80XU8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrfn4Q80XU8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrfn4Q80XU8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrfn4Q80XU8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrfn4Q80XU8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrfn4Q80XU8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrfn4Q80XU8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrfn4Q80XU8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrfn4Q80XU8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrfn4Q80XU8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrfn4Q80XU8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrfn4Q80XU8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrfn4Q80XU8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrfn4Q80XU8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrfn4Q80XU8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrfn4Q80XU8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrfn4Q80XU8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrfn4Q80XU8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lrfn4Q80XU8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lrfn4Q80XU8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrfn4Q80XU8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrfn4Q80XU8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrfn4Q80XU8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrfn4Q80XU8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrfn4Q80XU8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrfn4Q80XU8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrfn4Q80XU8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrfn4Q80XU8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrfn4Q80XU8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrfn4Q80XU8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrfn4Q80XU8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrfn4Q80XU8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrfn4Q80XU8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrfn4Q80XU8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrfn4Q80XU8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrfn4Q80XU8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrfn4Q80XU8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrfn4Q80XU8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrfn4Q80XU8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrfn4Q80XU8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrfn4Q80XU8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrfn4Q80XU8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrfn4Q80XU8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrfn4Q80XU8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrfn4Q80XU8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrfn4Q80XU8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrfn4Q80XU8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrfn4Q80XU8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrfn4Q80XU8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrfn4Q80XU8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrfn4Q80XU8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrfn4Q80XU8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrfn4Q80XU8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrfn4Q80XU8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrfn4Q80XU8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrfn4Q80XU8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrfn4Q80XU8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrfn4Q80XU8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrfn4Q80XU8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrfn4Q80XU8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrfn4Q80XU8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrfn4Q80XU8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrfn4Q80XU8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrfn4Q80XU8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrfn4Q80XU8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrfn4Q80XU8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrfn4Q80XU8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrfn4Q80XU8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrfn4Q80XU8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrfn4Q80XU8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrfn4Q80XU8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrfn4Q80XU8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrfn4Q80XU8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrfn4Q80XU8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrfn4Q80XU8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrfn4Q80XU8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrfn4Q80XU8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrfn4Q80XU8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrfn4Q80XU8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrfn4Q80XU8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrfn4Q80XU8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrfn4Q80XU8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrfn4Q80XU8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrfn4Q80XU8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrfn4Q80XU8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrfn4Q80XU8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms