Protein–RNA interactions for Protein: Q80VW5

Whrn, Whirlin, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WhrnQ80VW5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
WhrnQ80VW5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
WhrnQ80VW5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
WhrnQ80VW5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
WhrnQ80VW5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
WhrnQ80VW5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
WhrnQ80VW5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
WhrnQ80VW5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
WhrnQ80VW5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
WhrnQ80VW5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
WhrnQ80VW5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
WhrnQ80VW5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
WhrnQ80VW5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
WhrnQ80VW5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
WhrnQ80VW5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
WhrnQ80VW5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
WhrnQ80VW5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
WhrnQ80VW5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
WhrnQ80VW5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
WhrnQ80VW5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
WhrnQ80VW5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
WhrnQ80VW5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
WhrnQ80VW5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
WhrnQ80VW5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
WhrnQ80VW5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
WhrnQ80VW5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
WhrnQ80VW5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
WhrnQ80VW5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
WhrnQ80VW5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
WhrnQ80VW5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
WhrnQ80VW5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
WhrnQ80VW5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
WhrnQ80VW5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
WhrnQ80VW5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
WhrnQ80VW5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
WhrnQ80VW5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
WhrnQ80VW5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
WhrnQ80VW5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
WhrnQ80VW5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
WhrnQ80VW5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
WhrnQ80VW5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
WhrnQ80VW5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
WhrnQ80VW5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
WhrnQ80VW5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
WhrnQ80VW5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
WhrnQ80VW5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
WhrnQ80VW5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
WhrnQ80VW5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
WhrnQ80VW5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
WhrnQ80VW5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
WhrnQ80VW5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
WhrnQ80VW5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
WhrnQ80VW5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
WhrnQ80VW5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
WhrnQ80VW5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
WhrnQ80VW5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
WhrnQ80VW5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
WhrnQ80VW5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
WhrnQ80VW5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
WhrnQ80VW5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
WhrnQ80VW5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
WhrnQ80VW5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
WhrnQ80VW5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
WhrnQ80VW5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
WhrnQ80VW5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
WhrnQ80VW5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
WhrnQ80VW5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
WhrnQ80VW5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
WhrnQ80VW5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
WhrnQ80VW5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
WhrnQ80VW5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
WhrnQ80VW5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
WhrnQ80VW5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
WhrnQ80VW5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
WhrnQ80VW5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
WhrnQ80VW5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
WhrnQ80VW5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
WhrnQ80VW5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
WhrnQ80VW5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
WhrnQ80VW5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
WhrnQ80VW5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
WhrnQ80VW5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
WhrnQ80VW5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
WhrnQ80VW5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
WhrnQ80VW5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
WhrnQ80VW5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
WhrnQ80VW5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
WhrnQ80VW5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
WhrnQ80VW5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
WhrnQ80VW5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
WhrnQ80VW5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
WhrnQ80VW5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
WhrnQ80VW5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
WhrnQ80VW5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
WhrnQ80VW5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
WhrnQ80VW5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
WhrnQ80VW5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
WhrnQ80VW5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
WhrnQ80VW5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
WhrnQ80VW5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms