Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc1Q80VQ1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc1Q80VQ1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc1Q80VQ1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrc1Q80VQ1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrc1Q80VQ1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrc1Q80VQ1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrc1Q80VQ1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrc1Q80VQ1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrc1Q80VQ1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrrc1Q80VQ1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrrc1Q80VQ1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrrc1Q80VQ1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc1Q80VQ1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc1Q80VQ1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc1Q80VQ1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc1Q80VQ1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc1Q80VQ1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc1Q80VQ1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrc1Q80VQ1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrc1Q80VQ1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrc1Q80VQ1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrc1Q80VQ1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrc1Q80VQ1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc1Q80VQ1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc1Q80VQ1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc1Q80VQ1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc1Q80VQ1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc1Q80VQ1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc1Q80VQ1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc1Q80VQ1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc1Q80VQ1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc1Q80VQ1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc1Q80VQ1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc1Q80VQ1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc1Q80VQ1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc1Q80VQ1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc1Q80VQ1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc1Q80VQ1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc1Q80VQ1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc1Q80VQ1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc1Q80VQ1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc1Q80VQ1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc1Q80VQ1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc1Q80VQ1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc1Q80VQ1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc1Q80VQ1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc1Q80VQ1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrc1Q80VQ1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrc1Q80VQ1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrc1Q80VQ1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrc1Q80VQ1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrc1Q80VQ1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrc1Q80VQ1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrc1Q80VQ1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrc1Q80VQ1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrc1Q80VQ1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrc1Q80VQ1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrc1Q80VQ1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrc1Q80VQ1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrc1Q80VQ1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrc1Q80VQ1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrc1Q80VQ1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrc1Q80VQ1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrc1Q80VQ1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Lrrc1Q80VQ1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrc1Q80VQ1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrc1Q80VQ1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrc1Q80VQ1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrc1Q80VQ1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrc1Q80VQ1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrc1Q80VQ1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrc1Q80VQ1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrc1Q80VQ1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrc1Q80VQ1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrc1Q80VQ1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrc1Q80VQ1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrc1Q80VQ1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrc1Q80VQ1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrc1Q80VQ1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrc1Q80VQ1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrc1Q80VQ1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrc1Q80VQ1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrc1Q80VQ1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrc1Q80VQ1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrc1Q80VQ1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrc1Q80VQ1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrc1Q80VQ1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrc1Q80VQ1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrc1Q80VQ1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrc1Q80VQ1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrc1Q80VQ1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrc1Q80VQ1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrc1Q80VQ1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrc1Q80VQ1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrc1Q80VQ1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrc1Q80VQ1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrc1Q80VQ1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrc1Q80VQ1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrc1Q80VQ1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms