Protein–RNA interactions for Protein: Q80UJ7

Rab3gap1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3gap1Q80UJ7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rab3gap1Q80UJ7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Rab3gap1Q80UJ7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Rab3gap1Q80UJ7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rab3gap1Q80UJ7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rab3gap1Q80UJ7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rab3gap1Q80UJ7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rab3gap1Q80UJ7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rab3gap1Q80UJ7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rab3gap1Q80UJ7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rab3gap1Q80UJ7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rab3gap1Q80UJ7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rab3gap1Q80UJ7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rab3gap1Q80UJ7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rab3gap1Q80UJ7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rab3gap1Q80UJ7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rab3gap1Q80UJ7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rab3gap1Q80UJ7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rab3gap1Q80UJ7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rab3gap1Q80UJ7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rab3gap1Q80UJ7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rab3gap1Q80UJ7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rab3gap1Q80UJ7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rab3gap1Q80UJ7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rab3gap1Q80UJ7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rab3gap1Q80UJ7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rab3gap1Q80UJ7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rab3gap1Q80UJ7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rab3gap1Q80UJ7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Rab3gap1Q80UJ7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rab3gap1Q80UJ7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rab3gap1Q80UJ7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rab3gap1Q80UJ7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rab3gap1Q80UJ7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Rab3gap1Q80UJ7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rab3gap1Q80UJ7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rab3gap1Q80UJ7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rab3gap1Q80UJ7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rab3gap1Q80UJ7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rab3gap1Q80UJ7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rab3gap1Q80UJ7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rab3gap1Q80UJ7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rab3gap1Q80UJ7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rab3gap1Q80UJ7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rab3gap1Q80UJ7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rab3gap1Q80UJ7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rab3gap1Q80UJ7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rab3gap1Q80UJ7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Rab3gap1Q80UJ7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Rab3gap1Q80UJ7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rab3gap1Q80UJ7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rab3gap1Q80UJ7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Rab3gap1Q80UJ7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rab3gap1Q80UJ7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rab3gap1Q80UJ7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rab3gap1Q80UJ7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rab3gap1Q80UJ7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rab3gap1Q80UJ7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rab3gap1Q80UJ7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rab3gap1Q80UJ7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rab3gap1Q80UJ7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rab3gap1Q80UJ7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rab3gap1Q80UJ7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rab3gap1Q80UJ7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rab3gap1Q80UJ7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rab3gap1Q80UJ7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rab3gap1Q80UJ7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rab3gap1Q80UJ7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rab3gap1Q80UJ7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rab3gap1Q80UJ7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rab3gap1Q80UJ7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rab3gap1Q80UJ7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rab3gap1Q80UJ7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rab3gap1Q80UJ7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rab3gap1Q80UJ7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rab3gap1Q80UJ7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rab3gap1Q80UJ7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rab3gap1Q80UJ7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rab3gap1Q80UJ7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rab3gap1Q80UJ7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rab3gap1Q80UJ7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rab3gap1Q80UJ7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rab3gap1Q80UJ7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Rab3gap1Q80UJ7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rab3gap1Q80UJ7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rab3gap1Q80UJ7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rab3gap1Q80UJ7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Rab3gap1Q80UJ7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rab3gap1Q80UJ7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rab3gap1Q80UJ7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rab3gap1Q80UJ7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rab3gap1Q80UJ7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rab3gap1Q80UJ7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rab3gap1Q80UJ7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rab3gap1Q80UJ7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rab3gap1Q80UJ7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rab3gap1Q80UJ7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rab3gap1Q80UJ7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rab3gap1Q80UJ7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rab3gap1Q80UJ7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms