Protein–RNA interactions for Protein: Q80UF9

Otop3, Otopetrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otop3Q80UF9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Otop3Q80UF9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Otop3Q80UF9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Otop3Q80UF9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Otop3Q80UF9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Otop3Q80UF9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Otop3Q80UF9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Otop3Q80UF9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Otop3Q80UF9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Otop3Q80UF9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Otop3Q80UF9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Otop3Q80UF9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Otop3Q80UF9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Otop3Q80UF9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Otop3Q80UF9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Otop3Q80UF9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Otop3Q80UF9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Otop3Q80UF9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Otop3Q80UF9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Otop3Q80UF9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Otop3Q80UF9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Otop3Q80UF9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Otop3Q80UF9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Otop3Q80UF9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Otop3Q80UF9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Otop3Q80UF9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Otop3Q80UF9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Otop3Q80UF9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Otop3Q80UF9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Otop3Q80UF9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Otop3Q80UF9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Otop3Q80UF9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Otop3Q80UF9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Otop3Q80UF9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Otop3Q80UF9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Otop3Q80UF9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Otop3Q80UF9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Otop3Q80UF9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Otop3Q80UF9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Otop3Q80UF9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Otop3Q80UF9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Otop3Q80UF9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Otop3Q80UF9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Otop3Q80UF9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Otop3Q80UF9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Otop3Q80UF9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Otop3Q80UF9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Otop3Q80UF9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Otop3Q80UF9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Otop3Q80UF9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Otop3Q80UF9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Otop3Q80UF9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Otop3Q80UF9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Otop3Q80UF9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Otop3Q80UF9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Otop3Q80UF9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Otop3Q80UF9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Otop3Q80UF9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Otop3Q80UF9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Otop3Q80UF9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Otop3Q80UF9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Otop3Q80UF9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Otop3Q80UF9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Otop3Q80UF9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Otop3Q80UF9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Otop3Q80UF9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Otop3Q80UF9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Otop3Q80UF9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Otop3Q80UF9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Otop3Q80UF9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Otop3Q80UF9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Otop3Q80UF9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Otop3Q80UF9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Otop3Q80UF9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Otop3Q80UF9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Otop3Q80UF9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Otop3Q80UF9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Otop3Q80UF9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Otop3Q80UF9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Otop3Q80UF9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Otop3Q80UF9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Otop3Q80UF9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Otop3Q80UF9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Otop3Q80UF9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Otop3Q80UF9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Otop3Q80UF9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Otop3Q80UF9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Otop3Q80UF9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Otop3Q80UF9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Otop3Q80UF9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Otop3Q80UF9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Otop3Q80UF9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Otop3Q80UF9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Otop3Q80UF9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Otop3Q80UF9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Otop3Q80UF9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Otop3Q80UF9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Otop3Q80UF9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Otop3Q80UF9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Otop3Q80UF9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms