Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT79

Mcph1, Microcephalin, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcph1Q7TT79 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mcph1Q7TT79 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mcph1Q7TT79 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mcph1Q7TT79 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mcph1Q7TT79 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mcph1Q7TT79 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mcph1Q7TT79 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mcph1Q7TT79 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Mcph1Q7TT79 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mcph1Q7TT79 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mcph1Q7TT79 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mcph1Q7TT79 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Mcph1Q7TT79 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mcph1Q7TT79 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mcph1Q7TT79 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mcph1Q7TT79 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mcph1Q7TT79 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Mcph1Q7TT79 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mcph1Q7TT79 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mcph1Q7TT79 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mcph1Q7TT79 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mcph1Q7TT79 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mcph1Q7TT79 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mcph1Q7TT79 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mcph1Q7TT79 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Mcph1Q7TT79 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mcph1Q7TT79 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mcph1Q7TT79 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mcph1Q7TT79 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mcph1Q7TT79 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Mcph1Q7TT79 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mcph1Q7TT79 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mcph1Q7TT79 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mcph1Q7TT79 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Mcph1Q7TT79 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Mcph1Q7TT79 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mcph1Q7TT79 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mcph1Q7TT79 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Mcph1Q7TT79 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mcph1Q7TT79 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mcph1Q7TT79 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mcph1Q7TT79 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mcph1Q7TT79 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mcph1Q7TT79 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mcph1Q7TT79 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Mcph1Q7TT79 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mcph1Q7TT79 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mcph1Q7TT79 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mcph1Q7TT79 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mcph1Q7TT79 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mcph1Q7TT79 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mcph1Q7TT79 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mcph1Q7TT79 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mcph1Q7TT79 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mcph1Q7TT79 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mcph1Q7TT79 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mcph1Q7TT79 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mcph1Q7TT79 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mcph1Q7TT79 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mcph1Q7TT79 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mcph1Q7TT79 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mcph1Q7TT79 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mcph1Q7TT79 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mcph1Q7TT79 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mcph1Q7TT79 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mcph1Q7TT79 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mcph1Q7TT79 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mcph1Q7TT79 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mcph1Q7TT79 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mcph1Q7TT79 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Mcph1Q7TT79 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Mcph1Q7TT79 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mcph1Q7TT79 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mcph1Q7TT79 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mcph1Q7TT79 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mcph1Q7TT79 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mcph1Q7TT79 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mcph1Q7TT79 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mcph1Q7TT79 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mcph1Q7TT79 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mcph1Q7TT79 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Mcph1Q7TT79 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mcph1Q7TT79 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mcph1Q7TT79 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mcph1Q7TT79 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mcph1Q7TT79 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mcph1Q7TT79 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mcph1Q7TT79 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Mcph1Q7TT79 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mcph1Q7TT79 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mcph1Q7TT79 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mcph1Q7TT79 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Mcph1Q7TT79 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mcph1Q7TT79 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mcph1Q7TT79 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mcph1Q7TT79 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mcph1Q7TT79 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mcph1Q7TT79 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mcph1Q7TT79 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Mcph1Q7TT79 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms