Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSY8

Sgo2, Shugoshin 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2Q7TSY8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sgo2Q7TSY8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sgo2Q7TSY8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sgo2Q7TSY8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sgo2Q7TSY8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sgo2Q7TSY8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sgo2Q7TSY8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sgo2Q7TSY8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sgo2Q7TSY8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sgo2Q7TSY8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sgo2Q7TSY8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sgo2Q7TSY8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Sgo2Q7TSY8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sgo2Q7TSY8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Sgo2Q7TSY8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sgo2Q7TSY8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sgo2Q7TSY8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sgo2Q7TSY8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sgo2Q7TSY8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sgo2Q7TSY8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sgo2Q7TSY8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sgo2Q7TSY8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sgo2Q7TSY8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sgo2Q7TSY8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sgo2Q7TSY8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sgo2Q7TSY8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sgo2Q7TSY8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sgo2Q7TSY8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sgo2Q7TSY8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sgo2Q7TSY8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Sgo2Q7TSY8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sgo2Q7TSY8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sgo2Q7TSY8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sgo2Q7TSY8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sgo2Q7TSY8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sgo2Q7TSY8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Sgo2Q7TSY8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sgo2Q7TSY8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sgo2Q7TSY8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sgo2Q7TSY8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sgo2Q7TSY8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sgo2Q7TSY8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sgo2Q7TSY8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sgo2Q7TSY8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sgo2Q7TSY8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sgo2Q7TSY8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sgo2Q7TSY8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sgo2Q7TSY8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sgo2Q7TSY8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sgo2Q7TSY8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sgo2Q7TSY8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sgo2Q7TSY8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sgo2Q7TSY8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Sgo2Q7TSY8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sgo2Q7TSY8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sgo2Q7TSY8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sgo2Q7TSY8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sgo2Q7TSY8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sgo2Q7TSY8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sgo2Q7TSY8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sgo2Q7TSY8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sgo2Q7TSY8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sgo2Q7TSY8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sgo2Q7TSY8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sgo2Q7TSY8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sgo2Q7TSY8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sgo2Q7TSY8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sgo2Q7TSY8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sgo2Q7TSY8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sgo2Q7TSY8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sgo2Q7TSY8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sgo2Q7TSY8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sgo2Q7TSY8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sgo2Q7TSY8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Sgo2Q7TSY8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sgo2Q7TSY8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sgo2Q7TSY8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sgo2Q7TSY8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Sgo2Q7TSY8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sgo2Q7TSY8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sgo2Q7TSY8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sgo2Q7TSY8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sgo2Q7TSY8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sgo2Q7TSY8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sgo2Q7TSY8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sgo2Q7TSY8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sgo2Q7TSY8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sgo2Q7TSY8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sgo2Q7TSY8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sgo2Q7TSY8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sgo2Q7TSY8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sgo2Q7TSY8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sgo2Q7TSY8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Sgo2Q7TSY8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Sgo2Q7TSY8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sgo2Q7TSY8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sgo2Q7TSY8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sgo2Q7TSY8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sgo2Q7TSY8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sgo2Q7TSY8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms