Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kcnf1Q7TSH7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kcnf1Q7TSH7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kcnf1Q7TSH7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kcnf1Q7TSH7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kcnf1Q7TSH7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kcnf1Q7TSH7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kcnf1Q7TSH7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kcnf1Q7TSH7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kcnf1Q7TSH7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Kcnf1Q7TSH7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kcnf1Q7TSH7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kcnf1Q7TSH7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kcnf1Q7TSH7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kcnf1Q7TSH7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kcnf1Q7TSH7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Kcnf1Q7TSH7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kcnf1Q7TSH7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kcnf1Q7TSH7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kcnf1Q7TSH7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kcnf1Q7TSH7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kcnf1Q7TSH7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kcnf1Q7TSH7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kcnf1Q7TSH7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kcnf1Q7TSH7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kcnf1Q7TSH7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kcnf1Q7TSH7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kcnf1Q7TSH7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kcnf1Q7TSH7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kcnf1Q7TSH7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kcnf1Q7TSH7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kcnf1Q7TSH7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kcnf1Q7TSH7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kcnf1Q7TSH7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kcnf1Q7TSH7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kcnf1Q7TSH7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kcnf1Q7TSH7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kcnf1Q7TSH7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kcnf1Q7TSH7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Kcnf1Q7TSH7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kcnf1Q7TSH7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kcnf1Q7TSH7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kcnf1Q7TSH7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Kcnf1Q7TSH7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Kcnf1Q7TSH7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Kcnf1Q7TSH7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Kcnf1Q7TSH7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kcnf1Q7TSH7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kcnf1Q7TSH7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kcnf1Q7TSH7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kcnf1Q7TSH7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kcnf1Q7TSH7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcnf1Q7TSH7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcnf1Q7TSH7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcnf1Q7TSH7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcnf1Q7TSH7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcnf1Q7TSH7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcnf1Q7TSH7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcnf1Q7TSH7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcnf1Q7TSH7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcnf1Q7TSH7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcnf1Q7TSH7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcnf1Q7TSH7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcnf1Q7TSH7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcnf1Q7TSH7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcnf1Q7TSH7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcnf1Q7TSH7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcnf1Q7TSH7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcnf1Q7TSH7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcnf1Q7TSH7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcnf1Q7TSH7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcnf1Q7TSH7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcnf1Q7TSH7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcnf1Q7TSH7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcnf1Q7TSH7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcnf1Q7TSH7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcnf1Q7TSH7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kcnf1Q7TSH7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kcnf1Q7TSH7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kcnf1Q7TSH7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kcnf1Q7TSH7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kcnf1Q7TSH7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Kcnf1Q7TSH7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kcnf1Q7TSH7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kcnf1Q7TSH7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kcnf1Q7TSH7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcnf1Q7TSH7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcnf1Q7TSH7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcnf1Q7TSH7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcnf1Q7TSH7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcnf1Q7TSH7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcnf1Q7TSH7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kcnf1Q7TSH7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kcnf1Q7TSH7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Kcnf1Q7TSH7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Kcnf1Q7TSH7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kcnf1Q7TSH7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kcnf1Q7TSH7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kcnf1Q7TSH7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kcnf1Q7TSH7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms