Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nphp3Q7TNH6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nphp3Q7TNH6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nphp3Q7TNH6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nphp3Q7TNH6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nphp3Q7TNH6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nphp3Q7TNH6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Nphp3Q7TNH6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nphp3Q7TNH6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nphp3Q7TNH6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nphp3Q7TNH6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Nphp3Q7TNH6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Nphp3Q7TNH6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nphp3Q7TNH6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nphp3Q7TNH6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nphp3Q7TNH6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nphp3Q7TNH6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nphp3Q7TNH6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nphp3Q7TNH6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nphp3Q7TNH6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nphp3Q7TNH6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nphp3Q7TNH6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nphp3Q7TNH6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nphp3Q7TNH6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nphp3Q7TNH6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nphp3Q7TNH6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nphp3Q7TNH6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nphp3Q7TNH6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nphp3Q7TNH6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nphp3Q7TNH6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nphp3Q7TNH6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nphp3Q7TNH6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nphp3Q7TNH6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nphp3Q7TNH6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nphp3Q7TNH6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Nphp3Q7TNH6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Nphp3Q7TNH6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nphp3Q7TNH6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nphp3Q7TNH6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nphp3Q7TNH6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nphp3Q7TNH6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nphp3Q7TNH6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nphp3Q7TNH6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nphp3Q7TNH6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nphp3Q7TNH6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nphp3Q7TNH6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nphp3Q7TNH6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nphp3Q7TNH6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Nphp3Q7TNH6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nphp3Q7TNH6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Nphp3Q7TNH6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nphp3Q7TNH6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nphp3Q7TNH6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nphp3Q7TNH6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nphp3Q7TNH6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nphp3Q7TNH6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nphp3Q7TNH6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Nphp3Q7TNH6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Nphp3Q7TNH6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Nphp3Q7TNH6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nphp3Q7TNH6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nphp3Q7TNH6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nphp3Q7TNH6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nphp3Q7TNH6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nphp3Q7TNH6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nphp3Q7TNH6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nphp3Q7TNH6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nphp3Q7TNH6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nphp3Q7TNH6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nphp3Q7TNH6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nphp3Q7TNH6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nphp3Q7TNH6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nphp3Q7TNH6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nphp3Q7TNH6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nphp3Q7TNH6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nphp3Q7TNH6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Nphp3Q7TNH6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nphp3Q7TNH6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nphp3Q7TNH6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nphp3Q7TNH6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nphp3Q7TNH6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nphp3Q7TNH6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nphp3Q7TNH6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nphp3Q7TNH6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nphp3Q7TNH6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nphp3Q7TNH6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nphp3Q7TNH6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nphp3Q7TNH6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nphp3Q7TNH6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nphp3Q7TNH6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nphp3Q7TNH6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nphp3Q7TNH6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nphp3Q7TNH6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nphp3Q7TNH6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nphp3Q7TNH6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nphp3Q7TNH6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nphp3Q7TNH6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nphp3Q7TNH6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nphp3Q7TNH6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nphp3Q7TNH6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms