Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMB8

Cyfip1, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyfip1Q7TMB8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyfip1Q7TMB8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyfip1Q7TMB8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyfip1Q7TMB8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyfip1Q7TMB8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyfip1Q7TMB8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyfip1Q7TMB8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyfip1Q7TMB8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyfip1Q7TMB8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyfip1Q7TMB8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyfip1Q7TMB8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyfip1Q7TMB8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyfip1Q7TMB8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyfip1Q7TMB8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyfip1Q7TMB8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyfip1Q7TMB8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyfip1Q7TMB8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyfip1Q7TMB8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyfip1Q7TMB8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyfip1Q7TMB8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyfip1Q7TMB8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyfip1Q7TMB8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyfip1Q7TMB8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyfip1Q7TMB8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyfip1Q7TMB8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyfip1Q7TMB8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyfip1Q7TMB8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyfip1Q7TMB8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyfip1Q7TMB8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyfip1Q7TMB8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyfip1Q7TMB8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyfip1Q7TMB8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyfip1Q7TMB8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyfip1Q7TMB8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyfip1Q7TMB8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyfip1Q7TMB8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyfip1Q7TMB8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyfip1Q7TMB8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyfip1Q7TMB8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyfip1Q7TMB8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cyfip1Q7TMB8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cyfip1Q7TMB8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyfip1Q7TMB8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyfip1Q7TMB8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyfip1Q7TMB8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyfip1Q7TMB8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyfip1Q7TMB8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyfip1Q7TMB8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyfip1Q7TMB8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyfip1Q7TMB8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyfip1Q7TMB8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyfip1Q7TMB8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyfip1Q7TMB8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyfip1Q7TMB8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyfip1Q7TMB8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyfip1Q7TMB8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyfip1Q7TMB8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyfip1Q7TMB8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyfip1Q7TMB8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyfip1Q7TMB8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyfip1Q7TMB8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyfip1Q7TMB8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyfip1Q7TMB8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyfip1Q7TMB8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyfip1Q7TMB8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyfip1Q7TMB8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyfip1Q7TMB8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyfip1Q7TMB8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyfip1Q7TMB8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyfip1Q7TMB8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyfip1Q7TMB8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyfip1Q7TMB8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyfip1Q7TMB8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyfip1Q7TMB8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyfip1Q7TMB8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyfip1Q7TMB8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyfip1Q7TMB8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyfip1Q7TMB8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyfip1Q7TMB8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyfip1Q7TMB8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyfip1Q7TMB8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyfip1Q7TMB8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyfip1Q7TMB8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyfip1Q7TMB8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyfip1Q7TMB8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyfip1Q7TMB8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyfip1Q7TMB8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyfip1Q7TMB8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyfip1Q7TMB8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyfip1Q7TMB8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyfip1Q7TMB8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyfip1Q7TMB8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyfip1Q7TMB8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyfip1Q7TMB8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cyfip1Q7TMB8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cyfip1Q7TMB8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cyfip1Q7TMB8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cyfip1Q7TMB8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cyfip1Q7TMB8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cyfip1Q7TMB8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms