Protein–RNA interactions for Protein: Q76LS9

Mindy1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mindy1Q76LS9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mindy1Q76LS9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mindy1Q76LS9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mindy1Q76LS9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mindy1Q76LS9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mindy1Q76LS9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mindy1Q76LS9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mindy1Q76LS9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mindy1Q76LS9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mindy1Q76LS9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Mindy1Q76LS9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mindy1Q76LS9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mindy1Q76LS9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Mindy1Q76LS9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mindy1Q76LS9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mindy1Q76LS9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mindy1Q76LS9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Mindy1Q76LS9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mindy1Q76LS9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mindy1Q76LS9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mindy1Q76LS9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Mindy1Q76LS9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mindy1Q76LS9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mindy1Q76LS9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mindy1Q76LS9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mindy1Q76LS9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mindy1Q76LS9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mindy1Q76LS9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mindy1Q76LS9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mindy1Q76LS9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mindy1Q76LS9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mindy1Q76LS9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mindy1Q76LS9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mindy1Q76LS9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mindy1Q76LS9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mindy1Q76LS9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mindy1Q76LS9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Mindy1Q76LS9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mindy1Q76LS9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mindy1Q76LS9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mindy1Q76LS9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mindy1Q76LS9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mindy1Q76LS9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mindy1Q76LS9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mindy1Q76LS9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mindy1Q76LS9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mindy1Q76LS9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mindy1Q76LS9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mindy1Q76LS9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mindy1Q76LS9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mindy1Q76LS9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mindy1Q76LS9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Mindy1Q76LS9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mindy1Q76LS9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mindy1Q76LS9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mindy1Q76LS9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mindy1Q76LS9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mindy1Q76LS9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mindy1Q76LS9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mindy1Q76LS9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mindy1Q76LS9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mindy1Q76LS9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mindy1Q76LS9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mindy1Q76LS9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mindy1Q76LS9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mindy1Q76LS9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mindy1Q76LS9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mindy1Q76LS9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mindy1Q76LS9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mindy1Q76LS9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mindy1Q76LS9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mindy1Q76LS9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mindy1Q76LS9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mindy1Q76LS9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mindy1Q76LS9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mindy1Q76LS9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Mindy1Q76LS9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mindy1Q76LS9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mindy1Q76LS9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Mindy1Q76LS9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mindy1Q76LS9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mindy1Q76LS9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mindy1Q76LS9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mindy1Q76LS9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mindy1Q76LS9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mindy1Q76LS9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Mindy1Q76LS9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mindy1Q76LS9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mindy1Q76LS9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mindy1Q76LS9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mindy1Q76LS9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mindy1Q76LS9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Mindy1Q76LS9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mindy1Q76LS9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mindy1Q76LS9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mindy1Q76LS9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Mindy1Q76LS9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mindy1Q76LS9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Mindy1Q76LS9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mindy1Q76LS9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms