Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQL4

Wdr43, WD repeat-containing protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr43Q6ZQL4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Wdr43Q6ZQL4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Wdr43Q6ZQL4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Wdr43Q6ZQL4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Wdr43Q6ZQL4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Wdr43Q6ZQL4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Wdr43Q6ZQL4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Wdr43Q6ZQL4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Wdr43Q6ZQL4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Wdr43Q6ZQL4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Wdr43Q6ZQL4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Wdr43Q6ZQL4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Wdr43Q6ZQL4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Wdr43Q6ZQL4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Wdr43Q6ZQL4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Wdr43Q6ZQL4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Wdr43Q6ZQL4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Wdr43Q6ZQL4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Wdr43Q6ZQL4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Wdr43Q6ZQL4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Wdr43Q6ZQL4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Wdr43Q6ZQL4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Wdr43Q6ZQL4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Wdr43Q6ZQL4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Wdr43Q6ZQL4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Wdr43Q6ZQL4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Wdr43Q6ZQL4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Wdr43Q6ZQL4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Wdr43Q6ZQL4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Wdr43Q6ZQL4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Wdr43Q6ZQL4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Wdr43Q6ZQL4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Wdr43Q6ZQL4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Wdr43Q6ZQL4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Wdr43Q6ZQL4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Wdr43Q6ZQL4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Wdr43Q6ZQL4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Wdr43Q6ZQL4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Wdr43Q6ZQL4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Wdr43Q6ZQL4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Wdr43Q6ZQL4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Wdr43Q6ZQL4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Wdr43Q6ZQL4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Wdr43Q6ZQL4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Wdr43Q6ZQL4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Wdr43Q6ZQL4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Wdr43Q6ZQL4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Wdr43Q6ZQL4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Wdr43Q6ZQL4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Wdr43Q6ZQL4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Wdr43Q6ZQL4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Wdr43Q6ZQL4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Wdr43Q6ZQL4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Wdr43Q6ZQL4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Wdr43Q6ZQL4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Wdr43Q6ZQL4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Wdr43Q6ZQL4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Wdr43Q6ZQL4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Wdr43Q6ZQL4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Wdr43Q6ZQL4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Wdr43Q6ZQL4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Wdr43Q6ZQL4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Wdr43Q6ZQL4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Wdr43Q6ZQL4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Wdr43Q6ZQL4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Wdr43Q6ZQL4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Wdr43Q6ZQL4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Wdr43Q6ZQL4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Wdr43Q6ZQL4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Wdr43Q6ZQL4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Wdr43Q6ZQL4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Wdr43Q6ZQL4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Wdr43Q6ZQL4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Wdr43Q6ZQL4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Wdr43Q6ZQL4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Wdr43Q6ZQL4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Wdr43Q6ZQL4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Wdr43Q6ZQL4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Wdr43Q6ZQL4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Wdr43Q6ZQL4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Wdr43Q6ZQL4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Wdr43Q6ZQL4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Wdr43Q6ZQL4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Wdr43Q6ZQL4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Wdr43Q6ZQL4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Wdr43Q6ZQL4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Wdr43Q6ZQL4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Wdr43Q6ZQL4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Wdr43Q6ZQL4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Wdr43Q6ZQL4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Wdr43Q6ZQL4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Wdr43Q6ZQL4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Wdr43Q6ZQL4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Wdr43Q6ZQL4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Wdr43Q6ZQL4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Wdr43Q6ZQL4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Wdr43Q6ZQL4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Wdr43Q6ZQL4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Wdr43Q6ZQL4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Wdr43Q6ZQL4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms