Protein–RNA interactions for Protein: Q6XVG2

Cyp2c54, Cytochrome P450 2C54, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c54Q6XVG2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp2c54Q6XVG2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp2c54Q6XVG2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp2c54Q6XVG2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp2c54Q6XVG2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp2c54Q6XVG2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyp2c54Q6XVG2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyp2c54Q6XVG2 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyp2c54Q6XVG2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyp2c54Q6XVG2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyp2c54Q6XVG2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyp2c54Q6XVG2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyp2c54Q6XVG2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyp2c54Q6XVG2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyp2c54Q6XVG2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyp2c54Q6XVG2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyp2c54Q6XVG2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyp2c54Q6XVG2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyp2c54Q6XVG2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyp2c54Q6XVG2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyp2c54Q6XVG2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyp2c54Q6XVG2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyp2c54Q6XVG2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyp2c54Q6XVG2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyp2c54Q6XVG2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cyp2c54Q6XVG2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyp2c54Q6XVG2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyp2c54Q6XVG2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyp2c54Q6XVG2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyp2c54Q6XVG2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyp2c54Q6XVG2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyp2c54Q6XVG2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyp2c54Q6XVG2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyp2c54Q6XVG2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyp2c54Q6XVG2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyp2c54Q6XVG2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyp2c54Q6XVG2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyp2c54Q6XVG2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyp2c54Q6XVG2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyp2c54Q6XVG2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyp2c54Q6XVG2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp2c54Q6XVG2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp2c54Q6XVG2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp2c54Q6XVG2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp2c54Q6XVG2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp2c54Q6XVG2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp2c54Q6XVG2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp2c54Q6XVG2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp2c54Q6XVG2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp2c54Q6XVG2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp2c54Q6XVG2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyp2c54Q6XVG2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyp2c54Q6XVG2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyp2c54Q6XVG2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyp2c54Q6XVG2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyp2c54Q6XVG2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyp2c54Q6XVG2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyp2c54Q6XVG2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyp2c54Q6XVG2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyp2c54Q6XVG2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyp2c54Q6XVG2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyp2c54Q6XVG2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyp2c54Q6XVG2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyp2c54Q6XVG2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyp2c54Q6XVG2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyp2c54Q6XVG2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyp2c54Q6XVG2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyp2c54Q6XVG2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyp2c54Q6XVG2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyp2c54Q6XVG2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyp2c54Q6XVG2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyp2c54Q6XVG2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyp2c54Q6XVG2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyp2c54Q6XVG2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyp2c54Q6XVG2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cyp2c54Q6XVG2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cyp2c54Q6XVG2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cyp2c54Q6XVG2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cyp2c54Q6XVG2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cyp2c54Q6XVG2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cyp2c54Q6XVG2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cyp2c54Q6XVG2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cyp2c54Q6XVG2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyp2c54Q6XVG2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyp2c54Q6XVG2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyp2c54Q6XVG2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyp2c54Q6XVG2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyp2c54Q6XVG2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyp2c54Q6XVG2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyp2c54Q6XVG2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyp2c54Q6XVG2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyp2c54Q6XVG2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cyp2c54Q6XVG2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cyp2c54Q6XVG2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cyp2c54Q6XVG2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cyp2c54Q6XVG2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cyp2c54Q6XVG2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cyp2c54Q6XVG2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cyp2c54Q6XVG2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cyp2c54Q6XVG2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms