Protein–RNA interactions for Protein: Q6W8Q3

Pcp4l1, Purkinje cell protein 4-like protein 1, mousemouse

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Length 68 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcp4l1Q6W8Q3 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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