Protein–RNA interactions for Protein: Q6VUP9

Tfap2e, Transcription factor AP-2-epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2eQ6VUP9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tfap2eQ6VUP9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tfap2eQ6VUP9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tfap2eQ6VUP9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tfap2eQ6VUP9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tfap2eQ6VUP9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tfap2eQ6VUP9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tfap2eQ6VUP9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tfap2eQ6VUP9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tfap2eQ6VUP9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Tfap2eQ6VUP9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tfap2eQ6VUP9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tfap2eQ6VUP9 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tfap2eQ6VUP9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tfap2eQ6VUP9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tfap2eQ6VUP9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tfap2eQ6VUP9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tfap2eQ6VUP9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tfap2eQ6VUP9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tfap2eQ6VUP9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tfap2eQ6VUP9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tfap2eQ6VUP9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tfap2eQ6VUP9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tfap2eQ6VUP9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tfap2eQ6VUP9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tfap2eQ6VUP9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tfap2eQ6VUP9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Tfap2eQ6VUP9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Tfap2eQ6VUP9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Tfap2eQ6VUP9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tfap2eQ6VUP9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tfap2eQ6VUP9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Tfap2eQ6VUP9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tfap2eQ6VUP9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tfap2eQ6VUP9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tfap2eQ6VUP9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tfap2eQ6VUP9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tfap2eQ6VUP9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tfap2eQ6VUP9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tfap2eQ6VUP9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tfap2eQ6VUP9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tfap2eQ6VUP9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tfap2eQ6VUP9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tfap2eQ6VUP9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tfap2eQ6VUP9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tfap2eQ6VUP9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tfap2eQ6VUP9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tfap2eQ6VUP9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tfap2eQ6VUP9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tfap2eQ6VUP9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tfap2eQ6VUP9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tfap2eQ6VUP9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tfap2eQ6VUP9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tfap2eQ6VUP9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tfap2eQ6VUP9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tfap2eQ6VUP9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tfap2eQ6VUP9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tfap2eQ6VUP9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tfap2eQ6VUP9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tfap2eQ6VUP9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tfap2eQ6VUP9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tfap2eQ6VUP9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tfap2eQ6VUP9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tfap2eQ6VUP9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tfap2eQ6VUP9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Tfap2eQ6VUP9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tfap2eQ6VUP9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tfap2eQ6VUP9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tfap2eQ6VUP9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tfap2eQ6VUP9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Tfap2eQ6VUP9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tfap2eQ6VUP9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tfap2eQ6VUP9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tfap2eQ6VUP9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tfap2eQ6VUP9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tfap2eQ6VUP9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Tfap2eQ6VUP9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tfap2eQ6VUP9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Tfap2eQ6VUP9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tfap2eQ6VUP9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tfap2eQ6VUP9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tfap2eQ6VUP9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tfap2eQ6VUP9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tfap2eQ6VUP9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Tfap2eQ6VUP9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tfap2eQ6VUP9 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tfap2eQ6VUP9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tfap2eQ6VUP9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tfap2eQ6VUP9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tfap2eQ6VUP9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tfap2eQ6VUP9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tfap2eQ6VUP9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tfap2eQ6VUP9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tfap2eQ6VUP9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tfap2eQ6VUP9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tfap2eQ6VUP9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tfap2eQ6VUP9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tfap2eQ6VUP9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tfap2eQ6VUP9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tfap2eQ6VUP9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms