Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gja6Q6S5G4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gja6Q6S5G4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gja6Q6S5G4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gja6Q6S5G4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gja6Q6S5G4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gja6Q6S5G4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gja6Q6S5G4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gja6Q6S5G4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gja6Q6S5G4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gja6Q6S5G4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gja6Q6S5G4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gja6Q6S5G4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gja6Q6S5G4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gja6Q6S5G4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gja6Q6S5G4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gja6Q6S5G4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gja6Q6S5G4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gja6Q6S5G4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gja6Q6S5G4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gja6Q6S5G4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gja6Q6S5G4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gja6Q6S5G4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gja6Q6S5G4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gja6Q6S5G4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gja6Q6S5G4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gja6Q6S5G4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gja6Q6S5G4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gja6Q6S5G4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gja6Q6S5G4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gja6Q6S5G4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gja6Q6S5G4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gja6Q6S5G4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gja6Q6S5G4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gja6Q6S5G4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gja6Q6S5G4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Gja6Q6S5G4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gja6Q6S5G4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gja6Q6S5G4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gja6Q6S5G4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gja6Q6S5G4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gja6Q6S5G4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gja6Q6S5G4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gja6Q6S5G4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gja6Q6S5G4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gja6Q6S5G4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gja6Q6S5G4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gja6Q6S5G4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gja6Q6S5G4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gja6Q6S5G4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gja6Q6S5G4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gja6Q6S5G4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gja6Q6S5G4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gja6Q6S5G4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gja6Q6S5G4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gja6Q6S5G4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gja6Q6S5G4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gja6Q6S5G4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gja6Q6S5G4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gja6Q6S5G4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gja6Q6S5G4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gja6Q6S5G4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gja6Q6S5G4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gja6Q6S5G4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Gja6Q6S5G4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gja6Q6S5G4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gja6Q6S5G4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gja6Q6S5G4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gja6Q6S5G4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gja6Q6S5G4 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gja6Q6S5G4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gja6Q6S5G4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gja6Q6S5G4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gja6Q6S5G4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gja6Q6S5G4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gja6Q6S5G4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gja6Q6S5G4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gja6Q6S5G4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gja6Q6S5G4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gja6Q6S5G4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gja6Q6S5G4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gja6Q6S5G4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gja6Q6S5G4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Gja6Q6S5G4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gja6Q6S5G4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gja6Q6S5G4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gja6Q6S5G4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gja6Q6S5G4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gja6Q6S5G4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gja6Q6S5G4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gja6Q6S5G4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gja6Q6S5G4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gja6Q6S5G4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gja6Q6S5G4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gja6Q6S5G4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gja6Q6S5G4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Gja6Q6S5G4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gja6Q6S5G4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gja6Q6S5G4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gja6Q6S5G4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms