Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nudcd1Q6PIP5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nudcd1Q6PIP5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nudcd1Q6PIP5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nudcd1Q6PIP5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nudcd1Q6PIP5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nudcd1Q6PIP5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nudcd1Q6PIP5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nudcd1Q6PIP5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Nudcd1Q6PIP5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nudcd1Q6PIP5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nudcd1Q6PIP5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nudcd1Q6PIP5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nudcd1Q6PIP5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nudcd1Q6PIP5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nudcd1Q6PIP5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nudcd1Q6PIP5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nudcd1Q6PIP5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nudcd1Q6PIP5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nudcd1Q6PIP5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nudcd1Q6PIP5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nudcd1Q6PIP5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nudcd1Q6PIP5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nudcd1Q6PIP5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nudcd1Q6PIP5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nudcd1Q6PIP5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nudcd1Q6PIP5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nudcd1Q6PIP5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nudcd1Q6PIP5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nudcd1Q6PIP5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nudcd1Q6PIP5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nudcd1Q6PIP5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Nudcd1Q6PIP5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Nudcd1Q6PIP5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nudcd1Q6PIP5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nudcd1Q6PIP5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nudcd1Q6PIP5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nudcd1Q6PIP5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nudcd1Q6PIP5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nudcd1Q6PIP5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nudcd1Q6PIP5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nudcd1Q6PIP5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Nudcd1Q6PIP5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Nudcd1Q6PIP5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nudcd1Q6PIP5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nudcd1Q6PIP5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Nudcd1Q6PIP5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nudcd1Q6PIP5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nudcd1Q6PIP5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nudcd1Q6PIP5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nudcd1Q6PIP5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nudcd1Q6PIP5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nudcd1Q6PIP5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nudcd1Q6PIP5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nudcd1Q6PIP5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nudcd1Q6PIP5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nudcd1Q6PIP5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nudcd1Q6PIP5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Nudcd1Q6PIP5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nudcd1Q6PIP5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nudcd1Q6PIP5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nudcd1Q6PIP5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nudcd1Q6PIP5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nudcd1Q6PIP5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nudcd1Q6PIP5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nudcd1Q6PIP5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nudcd1Q6PIP5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Nudcd1Q6PIP5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nudcd1Q6PIP5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nudcd1Q6PIP5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nudcd1Q6PIP5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nudcd1Q6PIP5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nudcd1Q6PIP5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nudcd1Q6PIP5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nudcd1Q6PIP5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nudcd1Q6PIP5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nudcd1Q6PIP5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nudcd1Q6PIP5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nudcd1Q6PIP5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nudcd1Q6PIP5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nudcd1Q6PIP5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nudcd1Q6PIP5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nudcd1Q6PIP5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nudcd1Q6PIP5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nudcd1Q6PIP5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nudcd1Q6PIP5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nudcd1Q6PIP5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nudcd1Q6PIP5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nudcd1Q6PIP5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nudcd1Q6PIP5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nudcd1Q6PIP5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nudcd1Q6PIP5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nudcd1Q6PIP5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nudcd1Q6PIP5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nudcd1Q6PIP5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nudcd1Q6PIP5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nudcd1Q6PIP5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nudcd1Q6PIP5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nudcd1Q6PIP5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nudcd1Q6PIP5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms