Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ4

Nfrkb, Nuclear factor related to kappa-B-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfrkbQ6PIJ4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NfrkbQ6PIJ4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NfrkbQ6PIJ4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NfrkbQ6PIJ4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NfrkbQ6PIJ4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NfrkbQ6PIJ4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NfrkbQ6PIJ4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NfrkbQ6PIJ4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NfrkbQ6PIJ4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NfrkbQ6PIJ4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NfrkbQ6PIJ4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NfrkbQ6PIJ4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NfrkbQ6PIJ4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NfrkbQ6PIJ4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NfrkbQ6PIJ4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NfrkbQ6PIJ4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NfrkbQ6PIJ4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NfrkbQ6PIJ4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NfrkbQ6PIJ4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NfrkbQ6PIJ4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NfrkbQ6PIJ4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NfrkbQ6PIJ4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NfrkbQ6PIJ4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NfrkbQ6PIJ4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NfrkbQ6PIJ4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NfrkbQ6PIJ4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NfrkbQ6PIJ4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NfrkbQ6PIJ4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NfrkbQ6PIJ4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NfrkbQ6PIJ4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NfrkbQ6PIJ4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NfrkbQ6PIJ4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NfrkbQ6PIJ4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NfrkbQ6PIJ4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NfrkbQ6PIJ4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NfrkbQ6PIJ4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NfrkbQ6PIJ4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NfrkbQ6PIJ4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NfrkbQ6PIJ4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NfrkbQ6PIJ4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NfrkbQ6PIJ4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NfrkbQ6PIJ4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NfrkbQ6PIJ4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NfrkbQ6PIJ4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NfrkbQ6PIJ4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NfrkbQ6PIJ4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NfrkbQ6PIJ4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NfrkbQ6PIJ4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NfrkbQ6PIJ4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NfrkbQ6PIJ4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NfrkbQ6PIJ4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NfrkbQ6PIJ4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NfrkbQ6PIJ4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NfrkbQ6PIJ4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NfrkbQ6PIJ4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NfrkbQ6PIJ4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NfrkbQ6PIJ4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NfrkbQ6PIJ4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NfrkbQ6PIJ4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NfrkbQ6PIJ4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NfrkbQ6PIJ4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NfrkbQ6PIJ4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NfrkbQ6PIJ4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NfrkbQ6PIJ4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NfrkbQ6PIJ4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NfrkbQ6PIJ4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NfrkbQ6PIJ4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NfrkbQ6PIJ4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NfrkbQ6PIJ4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NfrkbQ6PIJ4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NfrkbQ6PIJ4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NfrkbQ6PIJ4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NfrkbQ6PIJ4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NfrkbQ6PIJ4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NfrkbQ6PIJ4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NfrkbQ6PIJ4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NfrkbQ6PIJ4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NfrkbQ6PIJ4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NfrkbQ6PIJ4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NfrkbQ6PIJ4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NfrkbQ6PIJ4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NfrkbQ6PIJ4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NfrkbQ6PIJ4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NfrkbQ6PIJ4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NfrkbQ6PIJ4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NfrkbQ6PIJ4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NfrkbQ6PIJ4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NfrkbQ6PIJ4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NfrkbQ6PIJ4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NfrkbQ6PIJ4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NfrkbQ6PIJ4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NfrkbQ6PIJ4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NfrkbQ6PIJ4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NfrkbQ6PIJ4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NfrkbQ6PIJ4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NfrkbQ6PIJ4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NfrkbQ6PIJ4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NfrkbQ6PIJ4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NfrkbQ6PIJ4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NfrkbQ6PIJ4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms