Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIC6

Atp1a3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a3Q6PIC6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp1a3Q6PIC6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp1a3Q6PIC6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp1a3Q6PIC6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp1a3Q6PIC6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp1a3Q6PIC6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp1a3Q6PIC6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp1a3Q6PIC6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp1a3Q6PIC6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp1a3Q6PIC6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp1a3Q6PIC6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp1a3Q6PIC6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp1a3Q6PIC6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Atp1a3Q6PIC6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Atp1a3Q6PIC6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp1a3Q6PIC6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp1a3Q6PIC6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp1a3Q6PIC6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp1a3Q6PIC6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp1a3Q6PIC6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp1a3Q6PIC6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp1a3Q6PIC6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp1a3Q6PIC6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp1a3Q6PIC6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp1a3Q6PIC6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp1a3Q6PIC6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp1a3Q6PIC6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp1a3Q6PIC6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp1a3Q6PIC6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp1a3Q6PIC6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp1a3Q6PIC6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp1a3Q6PIC6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp1a3Q6PIC6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp1a3Q6PIC6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp1a3Q6PIC6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp1a3Q6PIC6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp1a3Q6PIC6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp1a3Q6PIC6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp1a3Q6PIC6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp1a3Q6PIC6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp1a3Q6PIC6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp1a3Q6PIC6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp1a3Q6PIC6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp1a3Q6PIC6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp1a3Q6PIC6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp1a3Q6PIC6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp1a3Q6PIC6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp1a3Q6PIC6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp1a3Q6PIC6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp1a3Q6PIC6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp1a3Q6PIC6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp1a3Q6PIC6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp1a3Q6PIC6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp1a3Q6PIC6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp1a3Q6PIC6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp1a3Q6PIC6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp1a3Q6PIC6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp1a3Q6PIC6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp1a3Q6PIC6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp1a3Q6PIC6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp1a3Q6PIC6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp1a3Q6PIC6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp1a3Q6PIC6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp1a3Q6PIC6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp1a3Q6PIC6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp1a3Q6PIC6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp1a3Q6PIC6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp1a3Q6PIC6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp1a3Q6PIC6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp1a3Q6PIC6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp1a3Q6PIC6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp1a3Q6PIC6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp1a3Q6PIC6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp1a3Q6PIC6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp1a3Q6PIC6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp1a3Q6PIC6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp1a3Q6PIC6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp1a3Q6PIC6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp1a3Q6PIC6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp1a3Q6PIC6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp1a3Q6PIC6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp1a3Q6PIC6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp1a3Q6PIC6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp1a3Q6PIC6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp1a3Q6PIC6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp1a3Q6PIC6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp1a3Q6PIC6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp1a3Q6PIC6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp1a3Q6PIC6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp1a3Q6PIC6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp1a3Q6PIC6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp1a3Q6PIC6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp1a3Q6PIC6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp1a3Q6PIC6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp1a3Q6PIC6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp1a3Q6PIC6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp1a3Q6PIC6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp1a3Q6PIC6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp1a3Q6PIC6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp1a3Q6PIC6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.1 ms