Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHQ9

Pabpc4, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4Q6PHQ9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pabpc4Q6PHQ9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pabpc4Q6PHQ9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pabpc4Q6PHQ9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pabpc4Q6PHQ9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pabpc4Q6PHQ9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pabpc4Q6PHQ9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pabpc4Q6PHQ9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pabpc4Q6PHQ9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pabpc4Q6PHQ9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pabpc4Q6PHQ9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pabpc4Q6PHQ9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pabpc4Q6PHQ9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pabpc4Q6PHQ9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pabpc4Q6PHQ9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pabpc4Q6PHQ9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pabpc4Q6PHQ9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pabpc4Q6PHQ9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pabpc4Q6PHQ9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pabpc4Q6PHQ9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pabpc4Q6PHQ9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pabpc4Q6PHQ9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pabpc4Q6PHQ9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Pabpc4Q6PHQ9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pabpc4Q6PHQ9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pabpc4Q6PHQ9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pabpc4Q6PHQ9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pabpc4Q6PHQ9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pabpc4Q6PHQ9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pabpc4Q6PHQ9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pabpc4Q6PHQ9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pabpc4Q6PHQ9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pabpc4Q6PHQ9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pabpc4Q6PHQ9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pabpc4Q6PHQ9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Pabpc4Q6PHQ9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pabpc4Q6PHQ9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pabpc4Q6PHQ9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pabpc4Q6PHQ9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pabpc4Q6PHQ9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Pabpc4Q6PHQ9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pabpc4Q6PHQ9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pabpc4Q6PHQ9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pabpc4Q6PHQ9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pabpc4Q6PHQ9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pabpc4Q6PHQ9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pabpc4Q6PHQ9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pabpc4Q6PHQ9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pabpc4Q6PHQ9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pabpc4Q6PHQ9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pabpc4Q6PHQ9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pabpc4Q6PHQ9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pabpc4Q6PHQ9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Pabpc4Q6PHQ9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pabpc4Q6PHQ9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pabpc4Q6PHQ9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pabpc4Q6PHQ9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pabpc4Q6PHQ9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pabpc4Q6PHQ9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pabpc4Q6PHQ9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pabpc4Q6PHQ9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pabpc4Q6PHQ9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pabpc4Q6PHQ9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pabpc4Q6PHQ9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pabpc4Q6PHQ9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pabpc4Q6PHQ9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pabpc4Q6PHQ9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pabpc4Q6PHQ9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pabpc4Q6PHQ9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pabpc4Q6PHQ9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pabpc4Q6PHQ9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Pabpc4Q6PHQ9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pabpc4Q6PHQ9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pabpc4Q6PHQ9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pabpc4Q6PHQ9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pabpc4Q6PHQ9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pabpc4Q6PHQ9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pabpc4Q6PHQ9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pabpc4Q6PHQ9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pabpc4Q6PHQ9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pabpc4Q6PHQ9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pabpc4Q6PHQ9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pabpc4Q6PHQ9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pabpc4Q6PHQ9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pabpc4Q6PHQ9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pabpc4Q6PHQ9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pabpc4Q6PHQ9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pabpc4Q6PHQ9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pabpc4Q6PHQ9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pabpc4Q6PHQ9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pabpc4Q6PHQ9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pabpc4Q6PHQ9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Pabpc4Q6PHQ9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pabpc4Q6PHQ9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pabpc4Q6PHQ9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pabpc4Q6PHQ9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pabpc4Q6PHQ9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pabpc4Q6PHQ9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pabpc4Q6PHQ9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pabpc4Q6PHQ9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms