Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDZ2

Taf1c, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1cQ6PDZ2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Taf1cQ6PDZ2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Taf1cQ6PDZ2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Taf1cQ6PDZ2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Taf1cQ6PDZ2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Taf1cQ6PDZ2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Taf1cQ6PDZ2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Taf1cQ6PDZ2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Taf1cQ6PDZ2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Taf1cQ6PDZ2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Taf1cQ6PDZ2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Taf1cQ6PDZ2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Taf1cQ6PDZ2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Taf1cQ6PDZ2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Taf1cQ6PDZ2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Taf1cQ6PDZ2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Taf1cQ6PDZ2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Taf1cQ6PDZ2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Taf1cQ6PDZ2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Taf1cQ6PDZ2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Taf1cQ6PDZ2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Taf1cQ6PDZ2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Taf1cQ6PDZ2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Taf1cQ6PDZ2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Taf1cQ6PDZ2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Taf1cQ6PDZ2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Taf1cQ6PDZ2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Taf1cQ6PDZ2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Taf1cQ6PDZ2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Taf1cQ6PDZ2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Taf1cQ6PDZ2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Taf1cQ6PDZ2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Taf1cQ6PDZ2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Taf1cQ6PDZ2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Taf1cQ6PDZ2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Taf1cQ6PDZ2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Taf1cQ6PDZ2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Taf1cQ6PDZ2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Taf1cQ6PDZ2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Taf1cQ6PDZ2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Taf1cQ6PDZ2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Taf1cQ6PDZ2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Taf1cQ6PDZ2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Taf1cQ6PDZ2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Taf1cQ6PDZ2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Taf1cQ6PDZ2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Taf1cQ6PDZ2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Taf1cQ6PDZ2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Taf1cQ6PDZ2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Taf1cQ6PDZ2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Taf1cQ6PDZ2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Taf1cQ6PDZ2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Taf1cQ6PDZ2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Taf1cQ6PDZ2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Taf1cQ6PDZ2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Taf1cQ6PDZ2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Taf1cQ6PDZ2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Taf1cQ6PDZ2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Taf1cQ6PDZ2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Taf1cQ6PDZ2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Taf1cQ6PDZ2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Taf1cQ6PDZ2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Taf1cQ6PDZ2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Taf1cQ6PDZ2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Taf1cQ6PDZ2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Taf1cQ6PDZ2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Taf1cQ6PDZ2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Taf1cQ6PDZ2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Taf1cQ6PDZ2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Taf1cQ6PDZ2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Taf1cQ6PDZ2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Taf1cQ6PDZ2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Taf1cQ6PDZ2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Taf1cQ6PDZ2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Taf1cQ6PDZ2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Taf1cQ6PDZ2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Taf1cQ6PDZ2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Taf1cQ6PDZ2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Taf1cQ6PDZ2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Taf1cQ6PDZ2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Taf1cQ6PDZ2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Taf1cQ6PDZ2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Taf1cQ6PDZ2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Taf1cQ6PDZ2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Taf1cQ6PDZ2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Taf1cQ6PDZ2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Taf1cQ6PDZ2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Taf1cQ6PDZ2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Taf1cQ6PDZ2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Taf1cQ6PDZ2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Taf1cQ6PDZ2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Taf1cQ6PDZ2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Taf1cQ6PDZ2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Taf1cQ6PDZ2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Taf1cQ6PDZ2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Taf1cQ6PDZ2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Taf1cQ6PDZ2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Taf1cQ6PDZ2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Taf1cQ6PDZ2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Taf1cQ6PDZ2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms