Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc85bQ6PDY0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc85bQ6PDY0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc85bQ6PDY0 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc85bQ6PDY0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc85bQ6PDY0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc85bQ6PDY0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc85bQ6PDY0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc85bQ6PDY0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc85bQ6PDY0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc85bQ6PDY0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc85bQ6PDY0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc85bQ6PDY0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc85bQ6PDY0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc85bQ6PDY0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc85bQ6PDY0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc85bQ6PDY0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc85bQ6PDY0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc85bQ6PDY0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc85bQ6PDY0 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc85bQ6PDY0 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc85bQ6PDY0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc85bQ6PDY0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc85bQ6PDY0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc85bQ6PDY0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc85bQ6PDY0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc85bQ6PDY0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc85bQ6PDY0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc85bQ6PDY0 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc85bQ6PDY0 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc85bQ6PDY0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc85bQ6PDY0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc85bQ6PDY0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc85bQ6PDY0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc85bQ6PDY0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc85bQ6PDY0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc85bQ6PDY0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc85bQ6PDY0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc85bQ6PDY0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc85bQ6PDY0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc85bQ6PDY0 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc85bQ6PDY0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc85bQ6PDY0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc85bQ6PDY0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc85bQ6PDY0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc85bQ6PDY0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc85bQ6PDY0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc85bQ6PDY0 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc85bQ6PDY0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc85bQ6PDY0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc85bQ6PDY0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc85bQ6PDY0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc85bQ6PDY0 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc85bQ6PDY0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc85bQ6PDY0 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc85bQ6PDY0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc85bQ6PDY0 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc85bQ6PDY0 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc85bQ6PDY0 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc85bQ6PDY0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc85bQ6PDY0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc85bQ6PDY0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc85bQ6PDY0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc85bQ6PDY0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc85bQ6PDY0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc85bQ6PDY0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc85bQ6PDY0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc85bQ6PDY0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc85bQ6PDY0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc85bQ6PDY0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc85bQ6PDY0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc85bQ6PDY0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc85bQ6PDY0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc85bQ6PDY0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc85bQ6PDY0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc85bQ6PDY0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc85bQ6PDY0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc85bQ6PDY0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc85bQ6PDY0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc85bQ6PDY0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc85bQ6PDY0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc85bQ6PDY0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc85bQ6PDY0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc85bQ6PDY0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc85bQ6PDY0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc85bQ6PDY0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc85bQ6PDY0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc85bQ6PDY0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc85bQ6PDY0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc85bQ6PDY0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc85bQ6PDY0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc85bQ6PDY0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc85bQ6PDY0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc85bQ6PDY0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc85bQ6PDY0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc85bQ6PDY0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc85bQ6PDY0 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc85bQ6PDY0 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc85bQ6PDY0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc85bQ6PDY0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms