Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK8

Dtx4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dtx4Q6PDK8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dtx4Q6PDK8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dtx4Q6PDK8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dtx4Q6PDK8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dtx4Q6PDK8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dtx4Q6PDK8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dtx4Q6PDK8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dtx4Q6PDK8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dtx4Q6PDK8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dtx4Q6PDK8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dtx4Q6PDK8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dtx4Q6PDK8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Dtx4Q6PDK8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dtx4Q6PDK8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dtx4Q6PDK8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Dtx4Q6PDK8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dtx4Q6PDK8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dtx4Q6PDK8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dtx4Q6PDK8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dtx4Q6PDK8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Dtx4Q6PDK8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Dtx4Q6PDK8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Dtx4Q6PDK8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dtx4Q6PDK8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dtx4Q6PDK8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dtx4Q6PDK8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dtx4Q6PDK8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dtx4Q6PDK8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dtx4Q6PDK8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dtx4Q6PDK8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dtx4Q6PDK8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dtx4Q6PDK8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dtx4Q6PDK8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dtx4Q6PDK8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dtx4Q6PDK8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dtx4Q6PDK8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dtx4Q6PDK8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dtx4Q6PDK8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dtx4Q6PDK8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dtx4Q6PDK8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Dtx4Q6PDK8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dtx4Q6PDK8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dtx4Q6PDK8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dtx4Q6PDK8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dtx4Q6PDK8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dtx4Q6PDK8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dtx4Q6PDK8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dtx4Q6PDK8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dtx4Q6PDK8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dtx4Q6PDK8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dtx4Q6PDK8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dtx4Q6PDK8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dtx4Q6PDK8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dtx4Q6PDK8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dtx4Q6PDK8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dtx4Q6PDK8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dtx4Q6PDK8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Dtx4Q6PDK8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Dtx4Q6PDK8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dtx4Q6PDK8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dtx4Q6PDK8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dtx4Q6PDK8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dtx4Q6PDK8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Dtx4Q6PDK8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dtx4Q6PDK8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dtx4Q6PDK8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dtx4Q6PDK8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dtx4Q6PDK8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dtx4Q6PDK8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dtx4Q6PDK8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dtx4Q6PDK8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dtx4Q6PDK8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dtx4Q6PDK8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dtx4Q6PDK8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dtx4Q6PDK8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Dtx4Q6PDK8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dtx4Q6PDK8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dtx4Q6PDK8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Dtx4Q6PDK8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dtx4Q6PDK8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dtx4Q6PDK8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dtx4Q6PDK8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dtx4Q6PDK8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dtx4Q6PDK8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dtx4Q6PDK8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dtx4Q6PDK8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dtx4Q6PDK8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dtx4Q6PDK8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dtx4Q6PDK8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Dtx4Q6PDK8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dtx4Q6PDK8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Dtx4Q6PDK8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dtx4Q6PDK8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dtx4Q6PDK8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dtx4Q6PDK8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dtx4Q6PDK8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dtx4Q6PDK8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dtx4Q6PDK8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dtx4Q6PDK8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dtx4Q6PDK8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.7 ms