Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3E7

Hdac10, Histone deacetylase 10, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac10Q6P3E7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hdac10Q6P3E7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Hdac10Q6P3E7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hdac10Q6P3E7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hdac10Q6P3E7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hdac10Q6P3E7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hdac10Q6P3E7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hdac10Q6P3E7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hdac10Q6P3E7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hdac10Q6P3E7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdac10Q6P3E7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdac10Q6P3E7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdac10Q6P3E7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdac10Q6P3E7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdac10Q6P3E7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdac10Q6P3E7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdac10Q6P3E7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdac10Q6P3E7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdac10Q6P3E7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdac10Q6P3E7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdac10Q6P3E7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdac10Q6P3E7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdac10Q6P3E7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdac10Q6P3E7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hdac10Q6P3E7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hdac10Q6P3E7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hdac10Q6P3E7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hdac10Q6P3E7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hdac10Q6P3E7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hdac10Q6P3E7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdac10Q6P3E7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdac10Q6P3E7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdac10Q6P3E7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdac10Q6P3E7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdac10Q6P3E7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdac10Q6P3E7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdac10Q6P3E7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdac10Q6P3E7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hdac10Q6P3E7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hdac10Q6P3E7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Hdac10Q6P3E7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hdac10Q6P3E7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hdac10Q6P3E7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hdac10Q6P3E7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hdac10Q6P3E7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hdac10Q6P3E7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hdac10Q6P3E7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdac10Q6P3E7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdac10Q6P3E7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdac10Q6P3E7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdac10Q6P3E7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdac10Q6P3E7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdac10Q6P3E7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdac10Q6P3E7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdac10Q6P3E7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdac10Q6P3E7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdac10Q6P3E7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdac10Q6P3E7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdac10Q6P3E7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdac10Q6P3E7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdac10Q6P3E7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdac10Q6P3E7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdac10Q6P3E7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdac10Q6P3E7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdac10Q6P3E7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdac10Q6P3E7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hdac10Q6P3E7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Hdac10Q6P3E7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hdac10Q6P3E7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hdac10Q6P3E7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hdac10Q6P3E7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hdac10Q6P3E7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hdac10Q6P3E7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hdac10Q6P3E7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hdac10Q6P3E7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Hdac10Q6P3E7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hdac10Q6P3E7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hdac10Q6P3E7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hdac10Q6P3E7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Hdac10Q6P3E7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hdac10Q6P3E7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hdac10Q6P3E7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hdac10Q6P3E7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hdac10Q6P3E7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hdac10Q6P3E7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Hdac10Q6P3E7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hdac10Q6P3E7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hdac10Q6P3E7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hdac10Q6P3E7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hdac10Q6P3E7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hdac10Q6P3E7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hdac10Q6P3E7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hdac10Q6P3E7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Hdac10Q6P3E7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hdac10Q6P3E7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hdac10Q6P3E7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hdac10Q6P3E7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hdac10Q6P3E7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hdac10Q6P3E7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hdac10Q6P3E7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms