Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZQ4

Paxip1, PAX-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,056 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxip1Q6NZQ4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Paxip1Q6NZQ4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Paxip1Q6NZQ4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Paxip1Q6NZQ4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Paxip1Q6NZQ4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Paxip1Q6NZQ4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Paxip1Q6NZQ4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Paxip1Q6NZQ4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Paxip1Q6NZQ4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Paxip1Q6NZQ4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Paxip1Q6NZQ4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Paxip1Q6NZQ4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Paxip1Q6NZQ4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Paxip1Q6NZQ4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Paxip1Q6NZQ4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Paxip1Q6NZQ4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Paxip1Q6NZQ4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Paxip1Q6NZQ4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Paxip1Q6NZQ4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Paxip1Q6NZQ4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Paxip1Q6NZQ4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Paxip1Q6NZQ4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Paxip1Q6NZQ4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Paxip1Q6NZQ4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Paxip1Q6NZQ4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Paxip1Q6NZQ4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Paxip1Q6NZQ4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Paxip1Q6NZQ4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Paxip1Q6NZQ4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Paxip1Q6NZQ4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Paxip1Q6NZQ4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Paxip1Q6NZQ4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Paxip1Q6NZQ4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Paxip1Q6NZQ4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Paxip1Q6NZQ4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Paxip1Q6NZQ4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Paxip1Q6NZQ4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Paxip1Q6NZQ4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Paxip1Q6NZQ4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Paxip1Q6NZQ4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Paxip1Q6NZQ4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Paxip1Q6NZQ4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Paxip1Q6NZQ4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Paxip1Q6NZQ4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Paxip1Q6NZQ4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Paxip1Q6NZQ4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Paxip1Q6NZQ4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Paxip1Q6NZQ4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Paxip1Q6NZQ4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Paxip1Q6NZQ4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Paxip1Q6NZQ4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Paxip1Q6NZQ4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Paxip1Q6NZQ4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Paxip1Q6NZQ4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Paxip1Q6NZQ4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Paxip1Q6NZQ4 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Paxip1Q6NZQ4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Paxip1Q6NZQ4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Paxip1Q6NZQ4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Paxip1Q6NZQ4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Paxip1Q6NZQ4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Paxip1Q6NZQ4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Paxip1Q6NZQ4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Paxip1Q6NZQ4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Paxip1Q6NZQ4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Paxip1Q6NZQ4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Paxip1Q6NZQ4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Paxip1Q6NZQ4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Paxip1Q6NZQ4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Paxip1Q6NZQ4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Paxip1Q6NZQ4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Paxip1Q6NZQ4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Paxip1Q6NZQ4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Paxip1Q6NZQ4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Paxip1Q6NZQ4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Paxip1Q6NZQ4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Paxip1Q6NZQ4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Paxip1Q6NZQ4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Paxip1Q6NZQ4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Paxip1Q6NZQ4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Paxip1Q6NZQ4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Paxip1Q6NZQ4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Paxip1Q6NZQ4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Paxip1Q6NZQ4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Paxip1Q6NZQ4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Paxip1Q6NZQ4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Paxip1Q6NZQ4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Paxip1Q6NZQ4 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Paxip1Q6NZQ4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Paxip1Q6NZQ4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Paxip1Q6NZQ4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Paxip1Q6NZQ4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Paxip1Q6NZQ4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Paxip1Q6NZQ4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Paxip1Q6NZQ4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Paxip1Q6NZQ4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Paxip1Q6NZQ4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Paxip1Q6NZQ4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Paxip1Q6NZQ4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Paxip1Q6NZQ4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.3 ms