Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Rprd2Q6NXI6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Rprd2Q6NXI6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Rprd2Q6NXI6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Rprd2Q6NXI6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Rprd2Q6NXI6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Rprd2Q6NXI6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Rprd2Q6NXI6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Rprd2Q6NXI6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Rprd2Q6NXI6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Rprd2Q6NXI6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Rprd2Q6NXI6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rprd2Q6NXI6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Rprd2Q6NXI6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rprd2Q6NXI6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rprd2Q6NXI6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rprd2Q6NXI6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rprd2Q6NXI6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rprd2Q6NXI6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rprd2Q6NXI6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rprd2Q6NXI6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rprd2Q6NXI6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rprd2Q6NXI6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rprd2Q6NXI6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rprd2Q6NXI6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rprd2Q6NXI6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rprd2Q6NXI6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rprd2Q6NXI6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Rprd2Q6NXI6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rprd2Q6NXI6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rprd2Q6NXI6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rprd2Q6NXI6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rprd2Q6NXI6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rprd2Q6NXI6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rprd2Q6NXI6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rprd2Q6NXI6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Rprd2Q6NXI6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rprd2Q6NXI6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rprd2Q6NXI6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rprd2Q6NXI6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rprd2Q6NXI6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rprd2Q6NXI6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rprd2Q6NXI6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rprd2Q6NXI6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rprd2Q6NXI6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rprd2Q6NXI6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Rprd2Q6NXI6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Rprd2Q6NXI6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Rprd2Q6NXI6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Rprd2Q6NXI6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Rprd2Q6NXI6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rprd2Q6NXI6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rprd2Q6NXI6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rprd2Q6NXI6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rprd2Q6NXI6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rprd2Q6NXI6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rprd2Q6NXI6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rprd2Q6NXI6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rprd2Q6NXI6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Rprd2Q6NXI6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rprd2Q6NXI6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rprd2Q6NXI6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rprd2Q6NXI6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rprd2Q6NXI6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rprd2Q6NXI6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Rprd2Q6NXI6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rprd2Q6NXI6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rprd2Q6NXI6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rprd2Q6NXI6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Rprd2Q6NXI6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Rprd2Q6NXI6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rprd2Q6NXI6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rprd2Q6NXI6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rprd2Q6NXI6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rprd2Q6NXI6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rprd2Q6NXI6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rprd2Q6NXI6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rprd2Q6NXI6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Rprd2Q6NXI6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rprd2Q6NXI6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rprd2Q6NXI6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Rprd2Q6NXI6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Rprd2Q6NXI6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Rprd2Q6NXI6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Rprd2Q6NXI6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Rprd2Q6NXI6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Rprd2Q6NXI6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Rprd2Q6NXI6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Rprd2Q6NXI6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rprd2Q6NXI6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rprd2Q6NXI6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rprd2Q6NXI6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rprd2Q6NXI6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rprd2Q6NXI6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rprd2Q6NXI6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rprd2Q6NXI6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rprd2Q6NXI6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rprd2Q6NXI6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Rprd2Q6NXI6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rprd2Q6NXI6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms