Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS46

Pdcd11, Protein RRP5 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd11Q6NS46 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Pdcd11Q6NS46 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
Pdcd11Q6NS46 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Pdcd11Q6NS46 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Pdcd11Q6NS46 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Pdcd11Q6NS46 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Pdcd11Q6NS46 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Pdcd11Q6NS46 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Pdcd11Q6NS46 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Pdcd11Q6NS46 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Pdcd11Q6NS46 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Pdcd11Q6NS46 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Pdcd11Q6NS46 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Pdcd11Q6NS46 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Pdcd11Q6NS46 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
Pdcd11Q6NS46 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Pdcd11Q6NS46 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Pdcd11Q6NS46 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Pdcd11Q6NS46 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Pdcd11Q6NS46 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
Pdcd11Q6NS46 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Pdcd11Q6NS46 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
Pdcd11Q6NS46 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Pdcd11Q6NS46 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Pdcd11Q6NS46 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Pdcd11Q6NS46 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Pdcd11Q6NS46 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Pdcd11Q6NS46 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Pdcd11Q6NS46 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Pdcd11Q6NS46 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Pdcd11Q6NS46 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Pdcd11Q6NS46 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Pdcd11Q6NS46 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Pdcd11Q6NS46 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Pdcd11Q6NS46 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Pdcd11Q6NS46 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Pdcd11Q6NS46 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Pdcd11Q6NS46 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Pdcd11Q6NS46 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Pdcd11Q6NS46 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Pdcd11Q6NS46 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Pdcd11Q6NS46 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Pdcd11Q6NS46 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Pdcd11Q6NS46 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
Pdcd11Q6NS46 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
Pdcd11Q6NS46 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Pdcd11Q6NS46 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Pdcd11Q6NS46 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
Pdcd11Q6NS46 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Pdcd11Q6NS46 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Pdcd11Q6NS46 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Pdcd11Q6NS46 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Pdcd11Q6NS46 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Pdcd11Q6NS46 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Pdcd11Q6NS46 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Pdcd11Q6NS46 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Pdcd11Q6NS46 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Pdcd11Q6NS46 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Pdcd11Q6NS46 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Pdcd11Q6NS46 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Pdcd11Q6NS46 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Pdcd11Q6NS46 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Pdcd11Q6NS46 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
Pdcd11Q6NS46 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Pdcd11Q6NS46 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Pdcd11Q6NS46 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Pdcd11Q6NS46 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Pdcd11Q6NS46 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Pdcd11Q6NS46 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Pdcd11Q6NS46 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Pdcd11Q6NS46 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Pdcd11Q6NS46 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Pdcd11Q6NS46 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Pdcd11Q6NS46 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Pdcd11Q6NS46 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Pdcd11Q6NS46 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
Pdcd11Q6NS46 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Pdcd11Q6NS46 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Pdcd11Q6NS46 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Pdcd11Q6NS46 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Pdcd11Q6NS46 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Pdcd11Q6NS46 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Pdcd11Q6NS46 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Pdcd11Q6NS46 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Pdcd11Q6NS46 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Pdcd11Q6NS46 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Pdcd11Q6NS46 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Pdcd11Q6NS46 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Pdcd11Q6NS46 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Pdcd11Q6NS46 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Pdcd11Q6NS46 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Pdcd11Q6NS46 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Pdcd11Q6NS46 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Pdcd11Q6NS46 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Pdcd11Q6NS46 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Pdcd11Q6NS46 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Pdcd11Q6NS46 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Pdcd11Q6NS46 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Pdcd11Q6NS46 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Pdcd11Q6NS46 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms