Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atg16l2Q6KAU8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atg16l2Q6KAU8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atg16l2Q6KAU8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atg16l2Q6KAU8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atg16l2Q6KAU8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atg16l2Q6KAU8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atg16l2Q6KAU8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atg16l2Q6KAU8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atg16l2Q6KAU8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atg16l2Q6KAU8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atg16l2Q6KAU8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atg16l2Q6KAU8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atg16l2Q6KAU8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Atg16l2Q6KAU8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atg16l2Q6KAU8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atg16l2Q6KAU8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Atg16l2Q6KAU8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Atg16l2Q6KAU8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Atg16l2Q6KAU8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atg16l2Q6KAU8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atg16l2Q6KAU8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atg16l2Q6KAU8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atg16l2Q6KAU8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atg16l2Q6KAU8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atg16l2Q6KAU8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atg16l2Q6KAU8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atg16l2Q6KAU8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atg16l2Q6KAU8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atg16l2Q6KAU8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atg16l2Q6KAU8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atg16l2Q6KAU8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atg16l2Q6KAU8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atg16l2Q6KAU8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atg16l2Q6KAU8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atg16l2Q6KAU8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atg16l2Q6KAU8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atg16l2Q6KAU8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atg16l2Q6KAU8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atg16l2Q6KAU8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atg16l2Q6KAU8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atg16l2Q6KAU8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atg16l2Q6KAU8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atg16l2Q6KAU8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atg16l2Q6KAU8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atg16l2Q6KAU8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atg16l2Q6KAU8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atg16l2Q6KAU8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Atg16l2Q6KAU8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atg16l2Q6KAU8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atg16l2Q6KAU8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atg16l2Q6KAU8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atg16l2Q6KAU8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Atg16l2Q6KAU8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atg16l2Q6KAU8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atg16l2Q6KAU8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Atg16l2Q6KAU8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atg16l2Q6KAU8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atg16l2Q6KAU8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atg16l2Q6KAU8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atg16l2Q6KAU8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atg16l2Q6KAU8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atg16l2Q6KAU8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atg16l2Q6KAU8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atg16l2Q6KAU8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atg16l2Q6KAU8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atg16l2Q6KAU8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atg16l2Q6KAU8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atg16l2Q6KAU8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atg16l2Q6KAU8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atg16l2Q6KAU8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Atg16l2Q6KAU8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atg16l2Q6KAU8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atg16l2Q6KAU8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atg16l2Q6KAU8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atg16l2Q6KAU8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atg16l2Q6KAU8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atg16l2Q6KAU8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atg16l2Q6KAU8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atg16l2Q6KAU8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atg16l2Q6KAU8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atg16l2Q6KAU8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atg16l2Q6KAU8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atg16l2Q6KAU8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atg16l2Q6KAU8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atg16l2Q6KAU8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atg16l2Q6KAU8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atg16l2Q6KAU8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atg16l2Q6KAU8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atg16l2Q6KAU8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atg16l2Q6KAU8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Atg16l2Q6KAU8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atg16l2Q6KAU8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atg16l2Q6KAU8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Atg16l2Q6KAU8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atg16l2Q6KAU8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atg16l2Q6KAU8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atg16l2Q6KAU8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg16l2Q6KAU8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg16l2Q6KAU8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms