Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW5

Atp11b, Phospholipid-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11bQ6DFW5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp11bQ6DFW5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp11bQ6DFW5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Atp11bQ6DFW5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp11bQ6DFW5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp11bQ6DFW5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp11bQ6DFW5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp11bQ6DFW5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp11bQ6DFW5 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp11bQ6DFW5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp11bQ6DFW5 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp11bQ6DFW5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp11bQ6DFW5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp11bQ6DFW5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp11bQ6DFW5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp11bQ6DFW5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp11bQ6DFW5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp11bQ6DFW5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp11bQ6DFW5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp11bQ6DFW5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp11bQ6DFW5 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp11bQ6DFW5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp11bQ6DFW5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp11bQ6DFW5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp11bQ6DFW5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp11bQ6DFW5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp11bQ6DFW5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp11bQ6DFW5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp11bQ6DFW5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp11bQ6DFW5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp11bQ6DFW5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp11bQ6DFW5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp11bQ6DFW5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp11bQ6DFW5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp11bQ6DFW5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp11bQ6DFW5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp11bQ6DFW5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp11bQ6DFW5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp11bQ6DFW5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp11bQ6DFW5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp11bQ6DFW5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp11bQ6DFW5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp11bQ6DFW5 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp11bQ6DFW5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp11bQ6DFW5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp11bQ6DFW5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp11bQ6DFW5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp11bQ6DFW5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp11bQ6DFW5 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp11bQ6DFW5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp11bQ6DFW5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp11bQ6DFW5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp11bQ6DFW5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp11bQ6DFW5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp11bQ6DFW5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp11bQ6DFW5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp11bQ6DFW5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp11bQ6DFW5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp11bQ6DFW5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp11bQ6DFW5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp11bQ6DFW5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp11bQ6DFW5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atp11bQ6DFW5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atp11bQ6DFW5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp11bQ6DFW5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp11bQ6DFW5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp11bQ6DFW5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp11bQ6DFW5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp11bQ6DFW5 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp11bQ6DFW5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp11bQ6DFW5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp11bQ6DFW5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp11bQ6DFW5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp11bQ6DFW5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp11bQ6DFW5 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp11bQ6DFW5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp11bQ6DFW5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp11bQ6DFW5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp11bQ6DFW5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp11bQ6DFW5 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp11bQ6DFW5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp11bQ6DFW5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp11bQ6DFW5 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp11bQ6DFW5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp11bQ6DFW5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp11bQ6DFW5 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp11bQ6DFW5 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp11bQ6DFW5 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp11bQ6DFW5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp11bQ6DFW5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp11bQ6DFW5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp11bQ6DFW5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp11bQ6DFW5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp11bQ6DFW5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp11bQ6DFW5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp11bQ6DFW5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp11bQ6DFW5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp11bQ6DFW5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp11bQ6DFW5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp11bQ6DFW5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms