Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pdzrn3Q69ZS0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Pdzrn3Q69ZS0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pdzrn3Q69ZS0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pdzrn3Q69ZS0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pdzrn3Q69ZS0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pdzrn3Q69ZS0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pdzrn3Q69ZS0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pdzrn3Q69ZS0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pdzrn3Q69ZS0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Pdzrn3Q69ZS0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pdzrn3Q69ZS0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Pdzrn3Q69ZS0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Pdzrn3Q69ZS0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pdzrn3Q69ZS0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pdzrn3Q69ZS0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pdzrn3Q69ZS0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pdzrn3Q69ZS0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pdzrn3Q69ZS0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pdzrn3Q69ZS0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pdzrn3Q69ZS0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pdzrn3Q69ZS0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pdzrn3Q69ZS0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pdzrn3Q69ZS0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pdzrn3Q69ZS0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pdzrn3Q69ZS0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pdzrn3Q69ZS0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pdzrn3Q69ZS0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pdzrn3Q69ZS0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pdzrn3Q69ZS0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pdzrn3Q69ZS0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pdzrn3Q69ZS0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pdzrn3Q69ZS0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pdzrn3Q69ZS0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pdzrn3Q69ZS0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pdzrn3Q69ZS0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Pdzrn3Q69ZS0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pdzrn3Q69ZS0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pdzrn3Q69ZS0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pdzrn3Q69ZS0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pdzrn3Q69ZS0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pdzrn3Q69ZS0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pdzrn3Q69ZS0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pdzrn3Q69ZS0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pdzrn3Q69ZS0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pdzrn3Q69ZS0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pdzrn3Q69ZS0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Pdzrn3Q69ZS0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pdzrn3Q69ZS0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pdzrn3Q69ZS0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pdzrn3Q69ZS0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Pdzrn3Q69ZS0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pdzrn3Q69ZS0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pdzrn3Q69ZS0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pdzrn3Q69ZS0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pdzrn3Q69ZS0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pdzrn3Q69ZS0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pdzrn3Q69ZS0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pdzrn3Q69ZS0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pdzrn3Q69ZS0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pdzrn3Q69ZS0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pdzrn3Q69ZS0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pdzrn3Q69ZS0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pdzrn3Q69ZS0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pdzrn3Q69ZS0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pdzrn3Q69ZS0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pdzrn3Q69ZS0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Pdzrn3Q69ZS0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pdzrn3Q69ZS0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pdzrn3Q69ZS0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pdzrn3Q69ZS0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pdzrn3Q69ZS0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Pdzrn3Q69ZS0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pdzrn3Q69ZS0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pdzrn3Q69ZS0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pdzrn3Q69ZS0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pdzrn3Q69ZS0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pdzrn3Q69ZS0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pdzrn3Q69ZS0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pdzrn3Q69ZS0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pdzrn3Q69ZS0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Pdzrn3Q69ZS0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pdzrn3Q69ZS0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pdzrn3Q69ZS0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pdzrn3Q69ZS0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pdzrn3Q69ZS0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pdzrn3Q69ZS0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pdzrn3Q69ZS0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pdzrn3Q69ZS0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pdzrn3Q69ZS0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pdzrn3Q69ZS0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pdzrn3Q69ZS0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
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