Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z98

Brsk2, Serine/threonine-protein kinase BRSK2, mousemouse

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brsk2Q69Z98 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Brsk2Q69Z98 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Brsk2Q69Z98 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Brsk2Q69Z98 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Brsk2Q69Z98 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Brsk2Q69Z98 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Brsk2Q69Z98 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Brsk2Q69Z98 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brsk2Q69Z98 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brsk2Q69Z98 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brsk2Q69Z98 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Brsk2Q69Z98 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Brsk2Q69Z98 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Brsk2Q69Z98 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Brsk2Q69Z98 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Brsk2Q69Z98 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Brsk2Q69Z98 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Brsk2Q69Z98 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Brsk2Q69Z98 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Brsk2Q69Z98 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Brsk2Q69Z98 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Brsk2Q69Z98 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Brsk2Q69Z98 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Brsk2Q69Z98 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Brsk2Q69Z98 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Brsk2Q69Z98 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Brsk2Q69Z98 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Brsk2Q69Z98 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Brsk2Q69Z98 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Brsk2Q69Z98 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Brsk2Q69Z98 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Brsk2Q69Z98 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Brsk2Q69Z98 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Brsk2Q69Z98 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brsk2Q69Z98 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brsk2Q69Z98 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brsk2Q69Z98 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brsk2Q69Z98 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brsk2Q69Z98 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brsk2Q69Z98 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brsk2Q69Z98 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brsk2Q69Z98 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brsk2Q69Z98 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brsk2Q69Z98 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brsk2Q69Z98 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Brsk2Q69Z98 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Brsk2Q69Z98 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Brsk2Q69Z98 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Brsk2Q69Z98 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Brsk2Q69Z98 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Brsk2Q69Z98 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Brsk2Q69Z98 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Brsk2Q69Z98 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Brsk2Q69Z98 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Brsk2Q69Z98 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Brsk2Q69Z98 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Brsk2Q69Z98 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Brsk2Q69Z98 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Brsk2Q69Z98 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Brsk2Q69Z98 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Brsk2Q69Z98 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Brsk2Q69Z98 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Brsk2Q69Z98 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Brsk2Q69Z98 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Brsk2Q69Z98 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Brsk2Q69Z98 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Brsk2Q69Z98 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Brsk2Q69Z98 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Brsk2Q69Z98 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Brsk2Q69Z98 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Brsk2Q69Z98 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Brsk2Q69Z98 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Brsk2Q69Z98 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Brsk2Q69Z98 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Brsk2Q69Z98 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Brsk2Q69Z98 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Brsk2Q69Z98 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Brsk2Q69Z98 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Brsk2Q69Z98 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Brsk2Q69Z98 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Brsk2Q69Z98 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Brsk2Q69Z98 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Brsk2Q69Z98 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Brsk2Q69Z98 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Brsk2Q69Z98 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Brsk2Q69Z98 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Brsk2Q69Z98 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Brsk2Q69Z98 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Brsk2Q69Z98 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Brsk2Q69Z98 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Brsk2Q69Z98 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Brsk2Q69Z98 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Brsk2Q69Z98 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Brsk2Q69Z98 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Brsk2Q69Z98 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Brsk2Q69Z98 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Brsk2Q69Z98 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Brsk2Q69Z98 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Brsk2Q69Z98 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Brsk2Q69Z98 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms