Protein–RNA interactions for Protein: Q66K08

Cilp, Cartilage intermediate layer protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CilpQ66K08 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CilpQ66K08 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CilpQ66K08 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CilpQ66K08 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CilpQ66K08 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CilpQ66K08 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CilpQ66K08 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CilpQ66K08 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CilpQ66K08 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CilpQ66K08 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CilpQ66K08 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CilpQ66K08 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CilpQ66K08 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CilpQ66K08 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CilpQ66K08 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CilpQ66K08 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CilpQ66K08 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CilpQ66K08 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CilpQ66K08 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CilpQ66K08 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CilpQ66K08 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CilpQ66K08 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CilpQ66K08 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CilpQ66K08 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CilpQ66K08 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CilpQ66K08 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CilpQ66K08 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CilpQ66K08 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CilpQ66K08 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CilpQ66K08 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CilpQ66K08 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CilpQ66K08 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CilpQ66K08 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CilpQ66K08 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CilpQ66K08 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CilpQ66K08 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CilpQ66K08 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CilpQ66K08 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CilpQ66K08 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CilpQ66K08 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CilpQ66K08 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CilpQ66K08 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CilpQ66K08 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CilpQ66K08 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CilpQ66K08 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CilpQ66K08 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CilpQ66K08 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CilpQ66K08 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CilpQ66K08 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CilpQ66K08 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CilpQ66K08 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CilpQ66K08 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CilpQ66K08 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CilpQ66K08 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CilpQ66K08 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CilpQ66K08 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CilpQ66K08 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CilpQ66K08 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CilpQ66K08 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CilpQ66K08 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CilpQ66K08 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CilpQ66K08 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CilpQ66K08 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CilpQ66K08 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CilpQ66K08 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CilpQ66K08 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CilpQ66K08 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CilpQ66K08 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CilpQ66K08 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CilpQ66K08 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CilpQ66K08 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CilpQ66K08 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CilpQ66K08 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CilpQ66K08 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CilpQ66K08 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CilpQ66K08 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CilpQ66K08 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CilpQ66K08 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CilpQ66K08 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CilpQ66K08 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CilpQ66K08 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CilpQ66K08 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CilpQ66K08 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CilpQ66K08 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CilpQ66K08 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CilpQ66K08 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CilpQ66K08 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CilpQ66K08 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CilpQ66K08 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CilpQ66K08 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CilpQ66K08 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CilpQ66K08 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CilpQ66K08 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CilpQ66K08 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CilpQ66K08 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CilpQ66K08 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CilpQ66K08 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CilpQ66K08 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CilpQ66K08 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CilpQ66K08 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms