Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ctnna3Q65CL1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ctnna3Q65CL1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ctnna3Q65CL1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ctnna3Q65CL1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ctnna3Q65CL1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Ctnna3Q65CL1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ctnna3Q65CL1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ctnna3Q65CL1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ctnna3Q65CL1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ctnna3Q65CL1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ctnna3Q65CL1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ctnna3Q65CL1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ctnna3Q65CL1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ctnna3Q65CL1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ctnna3Q65CL1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ctnna3Q65CL1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ctnna3Q65CL1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ctnna3Q65CL1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ctnna3Q65CL1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctnna3Q65CL1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctnna3Q65CL1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctnna3Q65CL1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctnna3Q65CL1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctnna3Q65CL1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctnna3Q65CL1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ctnna3Q65CL1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ctnna3Q65CL1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ctnna3Q65CL1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ctnna3Q65CL1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ctnna3Q65CL1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ctnna3Q65CL1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ctnna3Q65CL1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ctnna3Q65CL1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ctnna3Q65CL1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ctnna3Q65CL1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ctnna3Q65CL1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ctnna3Q65CL1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ctnna3Q65CL1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ctnna3Q65CL1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ctnna3Q65CL1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ctnna3Q65CL1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ctnna3Q65CL1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ctnna3Q65CL1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ctnna3Q65CL1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ctnna3Q65CL1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ctnna3Q65CL1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ctnna3Q65CL1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ctnna3Q65CL1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ctnna3Q65CL1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ctnna3Q65CL1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ctnna3Q65CL1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ctnna3Q65CL1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ctnna3Q65CL1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ctnna3Q65CL1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctnna3Q65CL1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctnna3Q65CL1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctnna3Q65CL1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctnna3Q65CL1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctnna3Q65CL1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctnna3Q65CL1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctnna3Q65CL1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctnna3Q65CL1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctnna3Q65CL1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctnna3Q65CL1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctnna3Q65CL1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctnna3Q65CL1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctnna3Q65CL1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctnna3Q65CL1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctnna3Q65CL1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctnna3Q65CL1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctnna3Q65CL1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctnna3Q65CL1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ctnna3Q65CL1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ctnna3Q65CL1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ctnna3Q65CL1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ctnna3Q65CL1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ctnna3Q65CL1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ctnna3Q65CL1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ctnna3Q65CL1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ctnna3Q65CL1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctnna3Q65CL1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctnna3Q65CL1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctnna3Q65CL1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctnna3Q65CL1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctnna3Q65CL1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctnna3Q65CL1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctnna3Q65CL1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctnna3Q65CL1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctnna3Q65CL1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctnna3Q65CL1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctnna3Q65CL1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctnna3Q65CL1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctnna3Q65CL1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ctnna3Q65CL1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ctnna3Q65CL1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ctnna3Q65CL1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ctnna3Q65CL1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ctnna3Q65CL1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ctnna3Q65CL1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms